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Identificación y caracterización a nivel genómico de genes relacionados con altas temperaturas en

Autores: Wang, Cheng; Wang, Xiaojing; Zhou, Ping; Li, Changchun

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Identificación y caracterización a nivel genómico de genes relacionados con altas temperaturas en


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Proteínas de choque térmico
Genes
Estrés ambiental
Análisis de duplicación de genes
Alta temperatura
Tolerancia al estrés térmico

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 10

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las proteínas de choque térmico (HSPs) son chaperonas moleculares que desempeñan roles esenciales en el desarrollo de las plantas y en la respuesta a diversas tensiones ambientales. Comprender los genes es de gran importancia ya que se ve severamente afectado por el estrés térmico. En el presente estudio, se identificaron un total de 76 genes en el genoma, que se dividieron en cinco subfamilias según el peso molecular y la composición de dominios. Se realizaron análisis de la distribución cromosómica, la estructura del gen y el motivo conservado de los genes de la familia utilizando métodos de análisis bioinformático. El análisis de duplicación de genes mostró que se obtuvieron y retuvieron 15 y 8 genes de la duplicación WGD/segmental y la duplicación en tándem, respectivamente. El análisis de elementos reveló la importancia de los genes en las adaptaciones de las plantas al medio ambiente. Además, se investigaron los patrones de expresión de los genes de la familia en tratamiento con alta temperatura basado en nuestros datos de RNA-seq, que fueron verificados adicionalmente por qRT-PCR. Un análisis adicional reveló que nueve genes candidatos, incluidos seis genes de subfamilia y tres genes de subfamilia, podrían estar involucrados en el aumento de la tolerancia al estrés térmico. La localización subcelular de dos genes candidatos mostró que dos RdHSPs candidatos se expresaron y funcionaron en el cloroplasto y el núcleo, respectivamente. Estos resultados proporcionan una base para la caracterización funcional de los genes y las investigaciones sobre los mecanismos moleculares de respuesta al estrés térmico.

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