Una identificación a nivel del genoma y análisis de expresión de la familia de genes similares a la proteína de dominio de membrana de la franja de Caspary en respuesta a los obstáculos de cultivo continuo inducidos por p-HBA
Autores: Su, Yating; Zeeshan Ul Haq, Muhammad; Liu, Xiaofeng; Li, Yang; Yu, Jing; Yang, Dongmei; Wu, Yougen; Liu, Ya
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Una identificación a nivel del genoma y análisis de expresión de la familia de genes similares a la proteína de dominio de membrana de la franja de Caspary en respuesta a los obstáculos de cultivo continuo inducidos por p-HBA
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Franja caspariana
Proteína similar a dominio de membrana
Estrés abiótico
Familia de genes de pachulí
Localización subcelular
Análisis filogenético
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
Los genes similares a proteínas de dominio de membrana de la franja caspariana son genes clave para la formación y regulación de la franja caspariana y desempeñan un papel importante en el estrés abiótico de las plantas. Sin embargo, se ha investigado poco sobre los miembros, características y funciones biológicas de la familia de genes de pachulí. En este estudio, se identificaron 156 genes a nivel del genoma completo. La localización subcelular predijo que el 75.6% de las proteínas residen en la membrana celular. Un análisis filogenético categorizó los genes en cinco subclústeres junto con otros genes. En un análisis de elementos cis-actuantes, se identificaron un total de 16 elementos cis diferentes, entre los cuales el elemento foto-responsivo fue el más común en la familia de genes. Un análisis de transcriptoma mostró que el ácido p-hidroxibenzoico, una sustancia autóxica alelopática, afectó el patrón de expresión de, incluyendo un total de 27 genes regulados al alza y 30 genes regulados a la baja, lo que sugiere que estos pueden desempeñar un papel importante en la regulación de los obstáculos de cultivo continuo de pachulí al afectar la formación e integridad de las bandas de la franja caspariana. Estos resultados proporcionaron una base teórica para explorar y verificar la función de la familia de genes de pachulí y su papel en los obstáculos de cultivo continuo.
Descripción
Los genes similares a proteínas de dominio de membrana de la franja caspariana son genes clave para la formación y regulación de la franja caspariana y desempeñan un papel importante en el estrés abiótico de las plantas. Sin embargo, se ha investigado poco sobre los miembros, características y funciones biológicas de la familia de genes de pachulí. En este estudio, se identificaron 156 genes a nivel del genoma completo. La localización subcelular predijo que el 75.6% de las proteínas residen en la membrana celular. Un análisis filogenético categorizó los genes en cinco subclústeres junto con otros genes. En un análisis de elementos cis-actuantes, se identificaron un total de 16 elementos cis diferentes, entre los cuales el elemento foto-responsivo fue el más común en la familia de genes. Un análisis de transcriptoma mostró que el ácido p-hidroxibenzoico, una sustancia autóxica alelopática, afectó el patrón de expresión de, incluyendo un total de 27 genes regulados al alza y 30 genes regulados a la baja, lo que sugiere que estos pueden desempeñar un papel importante en la regulación de los obstáculos de cultivo continuo de pachulí al afectar la formación e integridad de las bandas de la franja caspariana. Estos resultados proporcionaron una base teórica para explorar y verificar la función de la familia de genes de pachulí y su papel en los obstáculos de cultivo continuo.