Identificación y análisis de miembros de la familia de genes en
Autores: Zhao, Zhenli; Wang, Fei; Deng, Minjie; Fan, Guoqiang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación y análisis de miembros de la familia de genes en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Oxidasa de polifenoles
Respuestas al estrés
Familia de genes
Cloroplastos
Expresión génica
Resistencia al estrés por sequía
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
La polifenol oxidasa (PPO) es una metaloproteinasa común en las plantas con roles importantes en las respuestas de las plantas a estrés abiótico y biótico. Hay evidencia de que las PPOs contribuyen a las respuestas al estrés. En este estudio, se identificaron y caracterizaron de manera integral los miembros de la familia de genes PPO utilizando métodos bioinformáticos, así como análisis de relaciones filogenéticas, estructura de genes y proteínas, sesgo en el uso de codones y expresión génica en respuesta al estrés. El genoma contenía 10 miembros de la familia de genes PPO que codifican de 406 a 593 aminoácidos, con un sesgo G/C. La mayoría estaban localizados en cloroplastos. La estructura del motivo se conservó entre los miembros de la familia, y las hélices alfa y los giros aleatorios fueron los elementos dominantes en la estructura secundaria. Los promotores contenían muchos elementos cis-actuantes, como auxina, giberelina, ácido salicílico, ácido abscísico y elementos foto-responsivos. La formación de genes en esta familia estuvo vinculada a eventos evolutivos, como la replicación de fragmentos. Los resultados de PCR cuantitativa en tiempo real mostraron que pueden ser genes clave en la resistencia al estrés por sequía. Fueron genes sensibles al estrés. Estos resultados proporcionan una base confiable para comprender completamente las funciones potenciales de estos genes y la selección de la cría de resistencia.
Descripción
La polifenol oxidasa (PPO) es una metaloproteinasa común en las plantas con roles importantes en las respuestas de las plantas a estrés abiótico y biótico. Hay evidencia de que las PPOs contribuyen a las respuestas al estrés. En este estudio, se identificaron y caracterizaron de manera integral los miembros de la familia de genes PPO utilizando métodos bioinformáticos, así como análisis de relaciones filogenéticas, estructura de genes y proteínas, sesgo en el uso de codones y expresión génica en respuesta al estrés. El genoma contenía 10 miembros de la familia de genes PPO que codifican de 406 a 593 aminoácidos, con un sesgo G/C. La mayoría estaban localizados en cloroplastos. La estructura del motivo se conservó entre los miembros de la familia, y las hélices alfa y los giros aleatorios fueron los elementos dominantes en la estructura secundaria. Los promotores contenían muchos elementos cis-actuantes, como auxina, giberelina, ácido salicílico, ácido abscísico y elementos foto-responsivos. La formación de genes en esta familia estuvo vinculada a eventos evolutivos, como la replicación de fragmentos. Los resultados de PCR cuantitativa en tiempo real mostraron que pueden ser genes clave en la resistencia al estrés por sequía. Fueron genes sensibles al estrés. Estos resultados proporcionan una base confiable para comprender completamente las funciones potenciales de estos genes y la selección de la cría de resistencia.