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Identificación y análisis de genes relacionados con el estrés del retículo endoplásmico y el estrés salino en el genoma: se somete al empalme en respuesta al estrés salino y al estrés del RE

Autores: Guan, Peiyan; Zhao, Dongbo; Zhang, Chenxi; Qiu, Zhennan; Chen, Qingshuai; Solyanikova, Inna P.; Sun, Peinan; Cui, Peipei; Yu, Ru; Zhang, Xia; Li, Yanmei; Hu, Linshuang

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2025

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Acceso abierto

Artículo científico
2025

Identificación y análisis de genes relacionados con el estrés del retículo endoplásmico y el estrés salino en el genoma: se somete al empalme en respuesta al estrés salino y al estrés del RE


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Estrés por sal
Estrés en el ER
Rendimiento de papas
Genes
Análisis de datos del transcriptoma
Ensayo de qRT-PCR

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 25

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
El estrés por sal puede desencadenar estrés del retículo endoplásmico (RE) y afectar el rendimiento de la patata. El sistema de endomembranas está regulado de forma estricta en respuesta al estrés por sal para mantener la homeostasis celular. Sin embargo, se sabe poco sobre los genes involucrados en las vías citoprotectoras mediadas por el RE en plantas de patata. Los genes previamente caracterizados involucrados en la vía de señalización del estrés del RE en Arabidopsis se utilizaron como prototipos. Identificamos 29 genes involucrados en la respuesta al estrés del RE en el genoma de la patata. El análisis de datos del transcriptoma mostró que los niveles de expresión de los genes relacionados eran significativamente diferentes en diferentes tejidos. La mayoría de los genes pueden responder al ácido beta-aminobutírico, benzotiadiazol, sal y manitol. El ensayo de qRT-PCR reveló que podían responder al NaCl y a la tunicamicina, lo cual fue consistente con el hecho de que la región promotora de los genes relacionados contenía elementos relacionados con el estrés del RE y el estrés abiótico. Además, encontramos que tiene una forma de empalme, , bajo estrés por sal y RE, que puede empalmarse en el sitio CxGxxG en el C terminus para crear un cambio de marco a través de la excisión de 23 pares de bases. StbZIP60 está localizado en el citoplasma y el núcleo, mientras que la mayoría de los StbZIP60s se translocaron al núcleo. Este estudio proporciona una base para análisis adicionales de las funciones de los genes relacionados con el estrés por sal y el estrés del RE en plantas de patata.

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