Identificación y análisis de expresión de la familia de genes y en granada ( L.) a nivel genómico
Autores: Ren, Yuan; Ge, Dapeng; Dong, Jianmei; Guo, Linhui; Yuan, Zhaohe
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Identificación y análisis de expresión de la familia de genes y en granada ( L.) a nivel genómico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Proteína quinasa activada por mitógenos
Cascada
Análisis a nivel genómico
Granadas
Localización cromosómica
Análisis filogenético
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
La cascada de la quinasa activada por mitógenos (MAPK) está involucrada en la regulación de una serie de procesos biológicos en los organismos, que están compuestos de , y . Aunque los análisis a nivel genómico de esto han sido bien descritos en algunas especies, se sabe poco sobre y genes en granadas. En este estudio, identificamos , a través de una búsqueda a nivel genómico. La localización cromosómica mostró que 27 genes están distribuidos en 7 cromosomas con diferentes densidades. El alineamiento de secuencias múltiples y el análisis filogenético revelaron que y podrían dividirse en 4 subfamilias (grupos A, B, C y D), respectivamente. Además, el análisis estructural de exones-intrones de cada gen candidato ha indicado altos niveles de conservación dentro y entre grupos filogenéticos. El análisis de elementos cis-actuantes predijo que y estaban ampliamente involucrados en el crecimiento, desarrollo, estrés y respuesta hormonal de la granada. Los análisis del perfil de expresión de y se realizaron en diferentes tejidos (raíz, hoja, flor y fruto), y se expresó significativamente en todos los tejidos. Hasta donde sabemos, este es el primer análisis a nivel genómico de la familia de genes y en granada. Este estudio proporciona información valiosa para comprender la clasificación y funciones de la señal MAPK de la granada.
Descripción
La cascada de la quinasa activada por mitógenos (MAPK) está involucrada en la regulación de una serie de procesos biológicos en los organismos, que están compuestos de , y . Aunque los análisis a nivel genómico de esto han sido bien descritos en algunas especies, se sabe poco sobre y genes en granadas. En este estudio, identificamos , a través de una búsqueda a nivel genómico. La localización cromosómica mostró que 27 genes están distribuidos en 7 cromosomas con diferentes densidades. El alineamiento de secuencias múltiples y el análisis filogenético revelaron que y podrían dividirse en 4 subfamilias (grupos A, B, C y D), respectivamente. Además, el análisis estructural de exones-intrones de cada gen candidato ha indicado altos niveles de conservación dentro y entre grupos filogenéticos. El análisis de elementos cis-actuantes predijo que y estaban ampliamente involucrados en el crecimiento, desarrollo, estrés y respuesta hormonal de la granada. Los análisis del perfil de expresión de y se realizaron en diferentes tejidos (raíz, hoja, flor y fruto), y se expresó significativamente en todos los tejidos. Hasta donde sabemos, este es el primer análisis a nivel genómico de la familia de genes y en granada. Este estudio proporciona información valiosa para comprender la clasificación y funciones de la señal MAPK de la granada.