Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la superfamilia de genes en alfalfa ( L.)
Autores: Sod, Bilig; Xu, Lei; Liu, Yajiao; He, Fei; Xu, Yanchao; Li, Mingna; Yang, Tianhui; Gao, Ting; Kang, Junmei; Yang, Qingchuan; Long, Ruicai
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la superfamilia de genes en alfalfa ( L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
Sintasa de celulosa
Polisacáridos hemicelulósicos
Genoma de alfalfa
Ubicaciones cromosómicas
Elementos relacionados con el estrés abiótico
Adaptación al estrés
Licencia
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Consultas: 22
Citaciones: Sin citaciones
La familia de la súper familia de sintasa de celulosa () y semejante a la sintasa de celulosa () codifica enzimas críticas involucradas en el procesamiento de la celulosa vegetal y polisacáridos hemicelulósicos. El genoma de alfalfa ( L.) fue secuenciado en los últimos años, pero esta súper familia sigue siendo poco comprendida a nivel genómico. Identificamos 37 miembros de la familia del genoma de alfalfa en este estudio, así como sus ubicaciones cromosómicas y sintenias. Descubrimos que 28 estaban expresados en todos los tejidos y genes específicamente expresados en la raíz. Además, el análisis de elementos cis-activadores mostró que contenía varios elementos relacionados con el estrés abiótico. Además, el análisis transcriptómico de plántulas de alfalfa demostró la participación de esta súper familia en respuestas al frío, la sequía y el estrés salino. Específicamente, se observó un aumento en la expresión en condiciones de frío y una disminución bajo estrés osmótico, resaltando su potencial papel en la adaptación al estrés. Los hallazgos ofrecen información valiosa para la exploración práctica de las funciones de durante el desarrollo de la planta y el desarrollo de una mayor tolerancia a diferentes condiciones de estrés.
Descripción
La familia de la súper familia de sintasa de celulosa () y semejante a la sintasa de celulosa () codifica enzimas críticas involucradas en el procesamiento de la celulosa vegetal y polisacáridos hemicelulósicos. El genoma de alfalfa ( L.) fue secuenciado en los últimos años, pero esta súper familia sigue siendo poco comprendida a nivel genómico. Identificamos 37 miembros de la familia del genoma de alfalfa en este estudio, así como sus ubicaciones cromosómicas y sintenias. Descubrimos que 28 estaban expresados en todos los tejidos y genes específicamente expresados en la raíz. Además, el análisis de elementos cis-activadores mostró que contenía varios elementos relacionados con el estrés abiótico. Además, el análisis transcriptómico de plántulas de alfalfa demostró la participación de esta súper familia en respuestas al frío, la sequía y el estrés salino. Específicamente, se observó un aumento en la expresión en condiciones de frío y una disminución bajo estrés osmótico, resaltando su potencial papel en la adaptación al estrés. Los hallazgos ofrecen información valiosa para la exploración práctica de las funciones de durante el desarrollo de la planta y el desarrollo de una mayor tolerancia a diferentes condiciones de estrés.