Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes TALE en granada (L.)
Autores: Wang, Yuying; Zhao, Yujie; Yan, Ming; Zhao, Honglian; Zhang, Xinhui; Yuan, Zhaohe
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2020
Acceso abierto
Artículo científico
2020
Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes TALE en granada (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Familia de genes
Factor de transcripción
Desarrollo
Granada
Bioinformática
Investigación funcional
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 21
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes de bucle de extensión de tres aminoácidos (TALE) es un factor de transcripción clave que regula el desarrollo de órganos florales, la formación del meristemo floral, la morfogénesis de los órganos y el desarrollo de frutos. Un total de 17 genes de la familia TALE de granada fueron identificados y analizados en granada a través de métodos bioinformáticos, lo que proporcionó una base teórica para la investigación funcional y la utilización de los genes de la familia TALE de granada. Los resultados mostraron que los genes de la familia se dividieron en ocho subfamilias (KNOX-, KNOX-, KNOX-, BELL-, BELL-, BELL-, BELL- y BELL-). Todos tenían un dominio KNOX o un dominio BELL, y sus estructuras eran conservadoras. La secuencia del promotor de 1500 pb tenía múltiples cis-elementos en respuesta a hormonas (auxina, giberelina) y estrés abiótico, lo que indica que la mayoría de los PgTALE estaban involucrados en el crecimiento y desarrollo de las granadas y en el estrés. La predicción de funciones y el análisis de redes de proteínas-proteínas mostraron que PgTALE puede participar en la regulación del desarrollo de meristemos apicales, flores, carpelos y óvulos. El análisis de los patrones de expresión génica mostró que la familia de genes TALE de granada tenía una especificidad de expresión tisular particular. En conclusión, el conocimiento del gen TALE adquirido en granada puede aplicarse también a otras frutas.
Descripción
La familia de genes de bucle de extensión de tres aminoácidos (TALE) es un factor de transcripción clave que regula el desarrollo de órganos florales, la formación del meristemo floral, la morfogénesis de los órganos y el desarrollo de frutos. Un total de 17 genes de la familia TALE de granada fueron identificados y analizados en granada a través de métodos bioinformáticos, lo que proporcionó una base teórica para la investigación funcional y la utilización de los genes de la familia TALE de granada. Los resultados mostraron que los genes de la familia se dividieron en ocho subfamilias (KNOX-, KNOX-, KNOX-, BELL-, BELL-, BELL-, BELL- y BELL-). Todos tenían un dominio KNOX o un dominio BELL, y sus estructuras eran conservadoras. La secuencia del promotor de 1500 pb tenía múltiples cis-elementos en respuesta a hormonas (auxina, giberelina) y estrés abiótico, lo que indica que la mayoría de los PgTALE estaban involucrados en el crecimiento y desarrollo de las granadas y en el estrés. La predicción de funciones y el análisis de redes de proteínas-proteínas mostraron que PgTALE puede participar en la regulación del desarrollo de meristemos apicales, flores, carpelos y óvulos. El análisis de los patrones de expresión génica mostró que la familia de genes TALE de granada tenía una especificidad de expresión tisular particular. En conclusión, el conocimiento del gen TALE adquirido en granada puede aplicarse también a otras frutas.