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Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes en pepino (L.)

Autores: Li, Xuelian; Li, Yihua; Qiao, Yali; Lu, Siting; Yao, Kangding; Wang, Chunlei; Liao, Weibiao

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes en pepino (L.)


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Familia de genes
Pepino
Procesos fisiológicos
Procesos de desarrollo
Respuestas al estrés
árbol filogenético

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 24

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La familia de genes () y () desempeña un papel crucial en varios procesos fisiológicos y de desarrollo, incluyendo la germinación de semillas, la fotomorfogénesis, la floración y las respuestas al estrés. Sin embargo, el análisis del genoma en pepino ( L.) no ha sido investigado sistemáticamente. En este estudio, se identificaron 20 genes en pepino. Los 20 miembros están distribuidos aleatoriamente en seis cromosomas. La examinación de la localización subcelular indicó que el núcleo es el sitio principal donde se encuentran predominantemente los 20 miembros. El análisis del árbol filogenético reveló además que los genes en pepino están agrupados en tres categorías distintas, mostrando un notable parecido con los genes correspondientes en otras especies de plantas. El análisis de los elementos cis-actuantes mostró que la mayoría de los genes contienen una variedad de hormonas, así como elementos relacionados con el estrés y la respuesta a la luz. Al examinar los patrones de expresión en varios tejidos, se pudo distinguir que estos genes se expresan prominentemente en raíces, tallos y hojas, siendo las raíces las que presentan el nivel más alto de expresión. Además, los 20 genes de pepino responden todos al éster metílico de ácido jasmónico (Me-JA) y al ácido abscísico (ABA), siendo significativamente inducidos por Me-JA y ABA, respectivamente. responde positivamente a los estreses de NaCl y PEG6000, y son significativamente inducidos por la oscuridad. Los hallazgos presentados en este estudio brindan un sólido apoyo para la posible participación de genes en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de los pepinos. Además, estos resultados sirven como una base sólida para futuras investigaciones en el análisis funcional de .

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