Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes en pepino (L.)
Autores: Li, Xuelian; Li, Yihua; Qiao, Yali; Lu, Siting; Yao, Kangding; Wang, Chunlei; Liao, Weibiao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis de expresión a nivel genómico de la familia de genes en pepino (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Familia de genes
Pepino
Procesos fisiológicos
Procesos de desarrollo
Respuestas al estrés
árbol filogenético
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 24
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes () y () desempeña un papel crucial en varios procesos fisiológicos y de desarrollo, incluyendo la germinación de semillas, la fotomorfogénesis, la floración y las respuestas al estrés. Sin embargo, el análisis del genoma en pepino ( L.) no ha sido investigado sistemáticamente. En este estudio, se identificaron 20 genes en pepino. Los 20 miembros están distribuidos aleatoriamente en seis cromosomas. La examinación de la localización subcelular indicó que el núcleo es el sitio principal donde se encuentran predominantemente los 20 miembros. El análisis del árbol filogenético reveló además que los genes en pepino están agrupados en tres categorías distintas, mostrando un notable parecido con los genes correspondientes en otras especies de plantas. El análisis de los elementos cis-actuantes mostró que la mayoría de los genes contienen una variedad de hormonas, así como elementos relacionados con el estrés y la respuesta a la luz. Al examinar los patrones de expresión en varios tejidos, se pudo distinguir que estos genes se expresan prominentemente en raíces, tallos y hojas, siendo las raíces las que presentan el nivel más alto de expresión. Además, los 20 genes de pepino responden todos al éster metílico de ácido jasmónico (Me-JA) y al ácido abscísico (ABA), siendo significativamente inducidos por Me-JA y ABA, respectivamente. responde positivamente a los estreses de NaCl y PEG6000, y son significativamente inducidos por la oscuridad. Los hallazgos presentados en este estudio brindan un sólido apoyo para la posible participación de genes en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de los pepinos. Además, estos resultados sirven como una base sólida para futuras investigaciones en el análisis funcional de .
Descripción
La familia de genes () y () desempeña un papel crucial en varios procesos fisiológicos y de desarrollo, incluyendo la germinación de semillas, la fotomorfogénesis, la floración y las respuestas al estrés. Sin embargo, el análisis del genoma en pepino ( L.) no ha sido investigado sistemáticamente. En este estudio, se identificaron 20 genes en pepino. Los 20 miembros están distribuidos aleatoriamente en seis cromosomas. La examinación de la localización subcelular indicó que el núcleo es el sitio principal donde se encuentran predominantemente los 20 miembros. El análisis del árbol filogenético reveló además que los genes en pepino están agrupados en tres categorías distintas, mostrando un notable parecido con los genes correspondientes en otras especies de plantas. El análisis de los elementos cis-actuantes mostró que la mayoría de los genes contienen una variedad de hormonas, así como elementos relacionados con el estrés y la respuesta a la luz. Al examinar los patrones de expresión en varios tejidos, se pudo distinguir que estos genes se expresan prominentemente en raíces, tallos y hojas, siendo las raíces las que presentan el nivel más alto de expresión. Además, los 20 genes de pepino responden todos al éster metílico de ácido jasmónico (Me-JA) y al ácido abscísico (ABA), siendo significativamente inducidos por Me-JA y ABA, respectivamente. responde positivamente a los estreses de NaCl y PEG6000, y son significativamente inducidos por la oscuridad. Los hallazgos presentados en este estudio brindan un sólido apoyo para la posible participación de genes en el crecimiento, desarrollo y respuesta al estrés de los pepinos. Además, estos resultados sirven como una base sólida para futuras investigaciones en el análisis funcional de .