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Identificación y análisis de , , , y familias de genes en

Autores: Arkhipov, Alexander A.; Dvorianinova, Ekaterina M.; Turba, Anastasia A.; Novakovskiy, Roman O.; Zubarev, Yury A.; Predushchenko, Pavel A.; Sigova, Elizaveta A.; Zhernova, Daiana A.; Borkhert, Elena V.; Pushkova, Elena N.; Ruan, Chengjiang; Melnikova, Nataliya V.; Dmitriev, Alexey A.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2024

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Acceso abierto

Artículo científico
2024

Identificación y análisis de , , , y familias de genes en


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Familias de genes
Síntesis de ácidos grasos
Espino cerval de mar
Datos de transcriptoma
Dominios conservados
Mecanismos de biosíntesis

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 13

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las (sintetasas II de beta-cetoacilo-proteína transportadora de acilo (ACP)), (tioesterasas de ácidos grasos), (desaturasa de estearoil-ACP) y (desaturasas de ácidos grasos) son las familias de genes vitales involucradas en la síntesis de ácidos grasos (AG) en L. Sin embargo, la información sobre el número y la ubicación de estos genes y cuáles son clave para la formación de AG en las semillas y pulpa de fruta no estaba completa. Nuestro estudio tuvo como objetivo resolver este problema utilizando las secuencias genómicas disponibles y los datos de transcriptoma que obtuvimos. Comparamos las secuencias de proteínas del espino cerval de mar con las de y verificamos la presencia de dominios conservados. Como resultado de los análisis estructurales y filogenéticos, se identificaron 4, 8, 9 y 12 genes en el genoma, que fueron clasificados en subfamilias: , , , , , y . Para analizar la expresión de los genes identificados, secuenciamos los transcriptomas de las semillas y la pulpa de fruta del espino cerval de mar en cuatro etapas de desarrollo, así como las hojas. El análisis reveló representantes de las familias , , y con alta expresión específica de tejido y etapa en semillas y pulpa. Es probable que estos genes desempeñen un papel clave en la biosíntesis de AG del espino cerval de mar. Los resultados obtenidos pueden ayudar a establecer los mecanismos de biosíntesis precisos de los AG y promover la cría de nuevas variedades de espino cerval de mar que tengan aceite con una composición de AG definida.

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