Identificación y análisis de , , , y familias de genes en
Autores: Arkhipov, Alexander A.; Dvorianinova, Ekaterina M.; Turba, Anastasia A.; Novakovskiy, Roman O.; Zubarev, Yury A.; Predushchenko, Pavel A.; Sigova, Elizaveta A.; Zhernova, Daiana A.; Borkhert, Elena V.; Pushkova, Elena N.; Ruan, Chengjiang; Melnikova, Nataliya V.; Dmitriev, Alexey A.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación y análisis de , , , y familias de genes en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familias de genes
Síntesis de ácidos grasos
Espino cerval de mar
Datos de transcriptoma
Dominios conservados
Mecanismos de biosíntesis
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
Las (sintetasas II de beta-cetoacilo-proteína transportadora de acilo (ACP)), (tioesterasas de ácidos grasos), (desaturasa de estearoil-ACP) y (desaturasas de ácidos grasos) son las familias de genes vitales involucradas en la síntesis de ácidos grasos (AG) en L. Sin embargo, la información sobre el número y la ubicación de estos genes y cuáles son clave para la formación de AG en las semillas y pulpa de fruta no estaba completa. Nuestro estudio tuvo como objetivo resolver este problema utilizando las secuencias genómicas disponibles y los datos de transcriptoma que obtuvimos. Comparamos las secuencias de proteínas del espino cerval de mar con las de y verificamos la presencia de dominios conservados. Como resultado de los análisis estructurales y filogenéticos, se identificaron 4, 8, 9 y 12 genes en el genoma, que fueron clasificados en subfamilias: , , , , , y . Para analizar la expresión de los genes identificados, secuenciamos los transcriptomas de las semillas y la pulpa de fruta del espino cerval de mar en cuatro etapas de desarrollo, así como las hojas. El análisis reveló representantes de las familias , , y con alta expresión específica de tejido y etapa en semillas y pulpa. Es probable que estos genes desempeñen un papel clave en la biosíntesis de AG del espino cerval de mar. Los resultados obtenidos pueden ayudar a establecer los mecanismos de biosíntesis precisos de los AG y promover la cría de nuevas variedades de espino cerval de mar que tengan aceite con una composición de AG definida.
Descripción
Las (sintetasas II de beta-cetoacilo-proteína transportadora de acilo (ACP)), (tioesterasas de ácidos grasos), (desaturasa de estearoil-ACP) y (desaturasas de ácidos grasos) son las familias de genes vitales involucradas en la síntesis de ácidos grasos (AG) en L. Sin embargo, la información sobre el número y la ubicación de estos genes y cuáles son clave para la formación de AG en las semillas y pulpa de fruta no estaba completa. Nuestro estudio tuvo como objetivo resolver este problema utilizando las secuencias genómicas disponibles y los datos de transcriptoma que obtuvimos. Comparamos las secuencias de proteínas del espino cerval de mar con las de y verificamos la presencia de dominios conservados. Como resultado de los análisis estructurales y filogenéticos, se identificaron 4, 8, 9 y 12 genes en el genoma, que fueron clasificados en subfamilias: , , , , , y . Para analizar la expresión de los genes identificados, secuenciamos los transcriptomas de las semillas y la pulpa de fruta del espino cerval de mar en cuatro etapas de desarrollo, así como las hojas. El análisis reveló representantes de las familias , , y con alta expresión específica de tejido y etapa en semillas y pulpa. Es probable que estos genes desempeñen un papel clave en la biosíntesis de AG del espino cerval de mar. Los resultados obtenidos pueden ayudar a establecer los mecanismos de biosíntesis precisos de los AG y promover la cría de nuevas variedades de espino cerval de mar que tengan aceite con una composición de AG definida.