Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes EPF en (L.) Moench
Autores: Jiao, Zhiyin; Wang, Jinping; Shi, Yannan; Wang, Zhifang; Zhang, Jing; Du, Qi; Liu, Bocheng; Jia, Xinyue; Niu, Jingtian; Gu, Chun; Lv, Peng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes EPF en (L.) Moench
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factor de patrón epidérmico
Respuesta de la planta
Genoma de sorgo
Estrés por sequía
Herramientas de bioinformática
Cría resistente al estrés
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
El FACTOR DE PATTERNING EPIDÉRMICO (EPF) juega un papel crucial en la respuesta de las plantas al estrés abiótico. Aunque el EPF ha sido ampliamente estudiado en plantas modelo, hay una falta de investigación sobre la identificación de genes EPF en el genoma completo de sorgo y su respuesta al estrés por sequía. En este estudio, empleamos herramientas bioinformáticas para identificar 12 miembros de EPF en sorgo. El análisis del árbol filogenético reveló que los SbEPFs pueden categorizarse en cuatro ramas. Un examen más detallado de la estructura del gen y los motivos de conservación de proteínas de los miembros de la familia EPF demostró la alta conservación de la secuencia SbEPF. Se encontró que la región promotora de los SbEPFs abarca elementos cis-responsivos al estrés y hormonas vegetales. Además, los resultados cuantitativos de fluorescencia en tiempo real indicaron que los SbEPFs tienen una expresión específica de tejido. Bajo tratamiento de estrés por sequía, la mayoría de los miembros de SbEPF se reguló significativamente al alza, lo que indica su posible papel en la respuesta a la sequía. Nuestros hallazgos de investigación establecen una base para investigar la función de los SbEPFs y ofrecen genes candidatos para la mejora de la resistencia al estrés y la producción mejorada en sorgo.
Descripción
El FACTOR DE PATTERNING EPIDÉRMICO (EPF) juega un papel crucial en la respuesta de las plantas al estrés abiótico. Aunque el EPF ha sido ampliamente estudiado en plantas modelo, hay una falta de investigación sobre la identificación de genes EPF en el genoma completo de sorgo y su respuesta al estrés por sequía. En este estudio, empleamos herramientas bioinformáticas para identificar 12 miembros de EPF en sorgo. El análisis del árbol filogenético reveló que los SbEPFs pueden categorizarse en cuatro ramas. Un examen más detallado de la estructura del gen y los motivos de conservación de proteínas de los miembros de la familia EPF demostró la alta conservación de la secuencia SbEPF. Se encontró que la región promotora de los SbEPFs abarca elementos cis-responsivos al estrés y hormonas vegetales. Además, los resultados cuantitativos de fluorescencia en tiempo real indicaron que los SbEPFs tienen una expresión específica de tejido. Bajo tratamiento de estrés por sequía, la mayoría de los miembros de SbEPF se reguló significativamente al alza, lo que indica su posible papel en la respuesta a la sequía. Nuestros hallazgos de investigación establecen una base para investigar la función de los SbEPFs y ofrecen genes candidatos para la mejora de la resistencia al estrés y la producción mejorada en sorgo.