Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes entre tres especies
Autores: Li, Yaoting; Li, Lingli; Yang, Jiapeng; Niu, Zhitao; Liu, Wei; Lin, Yi; Xue, Qingyun; Ding, Xiaoyu
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes entre tres especies
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Orquídeas
Genes
Especies
Respuesta
Tratamiento
Importante
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Las orquídeas, que se encuentran entre las especies de orquídeas más conocidas, son apreciadas por su atractivo estético en todo el mundo. Además, debido a sus estrictas condiciones de vida, han acumulado altos niveles de ingredientes activos, lo que resulta no solo en su valor medicinal, sino también en su fuerte capacidad para responder a entornos adversos. La familia de genes juega un papel importante en el crecimiento y desarrollo de las plantas, así como en la transducción de señales. Sin embargo, estos genes no han sido investigados sistemáticamente en las especies. En este estudio, detectamos un total de 24, 23 y 14 miembros candidatos en las secuencias genómicas de , , y , respectivamente. Estos genes fueron clasificados en tres clados sobre la base de un análisis filogenético. Los números de genes entre especies seguían siendo altamente variables debido a la pérdida independiente de genes en el clado CIN. Sin embargo, solo se detectaron tres eventos de duplicación de genes, con solo un evento de duplicación en tándem (/) en y dos pares de eventos de duplicación de genes paralogos (/ y /) en . Se detectaron un total de 25 elementos -actuantes de s relacionados con hormonas/estrés y respuestas a la luz. Entre ellos, las proporciones de elementos de respuesta a hormonas, respuesta a la luz y respuesta a estrés en (100/421, 127/421 y 171/421) fueron similares a las de (83/352, 87/352 y 161/352). Usando qRT-PCR para determinar sus patrones de expresión bajo tratamiento con MeJA, cuatro s (, , , y ) se regulaban significativamente al alza bajo tratamiento con MeJA, lo que indica que los genes pueden desempeñar roles importantes en la respuesta al estrés. Bajo tratamiento con ABA, siete s (, , , , , , y ) se regulaban significativamente al alza, indicando que los genes también pueden desempeñar un papel importante en la respuesta a hormonas. Por lo tanto, estos resultados pueden proporcionar información útil para estudiar la evolución y función de los genes en las especies.
Descripción
Las orquídeas, que se encuentran entre las especies de orquídeas más conocidas, son apreciadas por su atractivo estético en todo el mundo. Además, debido a sus estrictas condiciones de vida, han acumulado altos niveles de ingredientes activos, lo que resulta no solo en su valor medicinal, sino también en su fuerte capacidad para responder a entornos adversos. La familia de genes juega un papel importante en el crecimiento y desarrollo de las plantas, así como en la transducción de señales. Sin embargo, estos genes no han sido investigados sistemáticamente en las especies. En este estudio, detectamos un total de 24, 23 y 14 miembros candidatos en las secuencias genómicas de , , y , respectivamente. Estos genes fueron clasificados en tres clados sobre la base de un análisis filogenético. Los números de genes entre especies seguían siendo altamente variables debido a la pérdida independiente de genes en el clado CIN. Sin embargo, solo se detectaron tres eventos de duplicación de genes, con solo un evento de duplicación en tándem (/) en y dos pares de eventos de duplicación de genes paralogos (/ y /) en . Se detectaron un total de 25 elementos -actuantes de s relacionados con hormonas/estrés y respuestas a la luz. Entre ellos, las proporciones de elementos de respuesta a hormonas, respuesta a la luz y respuesta a estrés en (100/421, 127/421 y 171/421) fueron similares a las de (83/352, 87/352 y 161/352). Usando qRT-PCR para determinar sus patrones de expresión bajo tratamiento con MeJA, cuatro s (, , , y ) se regulaban significativamente al alza bajo tratamiento con MeJA, lo que indica que los genes pueden desempeñar roles importantes en la respuesta al estrés. Bajo tratamiento con ABA, siete s (, , , , , , y ) se regulaban significativamente al alza, indicando que los genes también pueden desempeñar un papel importante en la respuesta a hormonas. Por lo tanto, estos resultados pueden proporcionar información útil para estudiar la evolución y función de los genes en las especies.