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Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes en el bambú Moso ()

Autores: Huang, Feiyi; Wang, Jiaxin; Tang, Chao

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de genes en el bambú Moso ()


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Proteínas de dedo de zinc-homeodominio
Bambú moso
Análisis filogenético
Familia de genes
Respuestas al estrés

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 9

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las proteínas de dedo de zinc y dominio homeótico (ZF-HD) desempeñan roles esenciales en el crecimiento, desarrollo y respuestas al estrés de las plantas. Sin embargo, el conocimiento sobre la expresión y la historia evolutiva de los genes en el bambú moso sigue siendo limitado. En este estudio, se encontraron un total de 24 genes distribuidos de manera desigual en 12 cromosomas en el bambú moso. El análisis filogenético indicó que los genes se dividieron en dos subfamilias: ZHD y MIF. Los genes de la subfamilia ZHD se clasificaron además en siete grupos según sus relaciones ortólogas con el arroz y la familia de genes. Se analizaron las estructuras de los genes y los motivos conservados de los mismos. La duplicación del genoma completo (WGD) o la duplicación segmentaria promovieron la evolución y expansión de la familia de genes del bambú moso. Las razones Ka/Ks sugirieron que los veinticuatro pares de duplicación habían experimentado selección purificadora. El análisis de promotores mostró que la mayoría de los genes contenían elementos asociados con respuestas al estrés y hormonas. El análisis de expresión demostró que muchos genes eran sensibles al tratamiento de estrés abiótico. En general, este trabajo investigó genes en el bambú moso utilizando enfoques bioinformáticos. La investigación evolutiva sobre la estructura de los genes, la distribución de motivos y los elementos reguladores indicó que los genes desempeñan roles distintos en los procesos biológicos, lo que proporciona una base teórica para explorar las funciones fisiológicas de los genes y seleccionar genes candidatos relacionados con el estrés en el bambú moso.

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