Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de factores de transcripción en
Autores: Liu, Dina; Gu, Chunsun; Fu, Zekai; Wang, Zhiquan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y análisis a nivel genómico de la familia de factores de transcripción en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Plantas
Respuestas al estrés
Procesos fisiológicos
MYBs
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción MYB constituyen una de las familias de genes más grandes en las plantas y desempeñan roles esenciales en la regulación del crecimiento de las plantas, las respuestas al estrés y una amplia variedad de procesos fisiológicos y bioquímicos. En este estudio, se identificaron 204 proteínas MYB (HhMYBs) en el genoma de Sieb. et Zucc y se analizaron sistemáticamente en función de su secuencia genómica y datos transcriptómicos. Las proteínas HhMYB candidatas y los MYBs se dividieron en 28 subfamilias basadas en el análisis de sus relaciones filogenéticas y sus patrones de motivos. El análisis de expresión utilizando RNA-seq y PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) indicó que la mayoría de los MYBs están regulados de manera diferencial bajo estrés por sequía y sal. El análisis de qRT-PCR de siete MYBs seleccionados sugirió que la familia HhMYB puede tener roles regulatorios en las respuestas al estrés y a las hormonas. Este estudio proporciona un marco para un análisis más completo del papel de los MYBs en la respuesta al estrés abiótico.
Descripción
Los factores de transcripción MYB constituyen una de las familias de genes más grandes en las plantas y desempeñan roles esenciales en la regulación del crecimiento de las plantas, las respuestas al estrés y una amplia variedad de procesos fisiológicos y bioquímicos. En este estudio, se identificaron 204 proteínas MYB (HhMYBs) en el genoma de Sieb. et Zucc y se analizaron sistemáticamente en función de su secuencia genómica y datos transcriptómicos. Las proteínas HhMYB candidatas y los MYBs se dividieron en 28 subfamilias basadas en el análisis de sus relaciones filogenéticas y sus patrones de motivos. El análisis de expresión utilizando RNA-seq y PCR cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) indicó que la mayoría de los MYBs están regulados de manera diferencial bajo estrés por sequía y sal. El análisis de qRT-PCR de siete MYBs seleccionados sugirió que la familia HhMYB puede tener roles regulatorios en las respuestas al estrés y a las hormonas. Este estudio proporciona un marco para un análisis más completo del papel de los MYBs en la respuesta al estrés abiótico.