La región del collar juega un papel crucial en la formación del ángulo de las hojas y la arquitectura de la planta, lo cual es importante para mejorar el rendimiento de los cultivos dado los desafíos de la disminución de tierras cultivables y las condiciones ambientales cambiantes. Para determinar los genes preferenciales de la región del collar (CRPGs) que afectan la arquitectura de la planta y el rendimiento de los cultivos, realizamos un análisis transcriptómico a nivel genómico. Al integrar nuestros datos de secuenciación de ARN con datos de expresión anatómica pública del arroz, identificamos 657 CRPGs. La verificación involucró la prueba de seis CRPGs seleccionados al azar, todos los cuales mostraron expresión preferencial en la región del collar. La importancia funcional de los CRPGs se evaluó a través de un análisis de enriquecimiento de Gene Ontology, utilizando MapMan y KEGG, y el análisis de literatura proporcionó información adicional para los CRPGs caracterizados. Nuestros hallazgos revelaron vínculos entre la manipulación del ángulo de las hojas y las vías relacionadas con fitohormonas y respuestas al estrés. Además, basándonos en los CRPGs, se identificaron cinco factores de transcripción aguas abajo del gen. En general, los CRPGs identificados proporcionan objetivos potenciales para futuras investigaciones y aplicaciones de cría destinadas a mejorar la productividad de los cultivos mediante la manipulación de la arquitectura de las hojas.