La cochinilla harinosa puede amenazar gravemente los cultivos agrícolas y hortícolas y tiene una distribución amplia en regiones tropicales, especialmente en áreas de invasión de alto riesgo como Hainan, que es un puerto comercial importante con condiciones geográficas superiores. Los métodos morfológicos tradicionales ya no pueden cumplir con los requisitos para la identificación rápida y precisa de diferentes etapas de insectos o residuos. El código de barras de ADN se ha utilizado para establecer herramientas eficientes de identificación molecular. En este estudio, se construyó con éxito un ensayo de reacción en cadena de la polimerasa multiplex (mPCR) basado en el gen de la subunidad I de la citocromo c oxidasa (COI) para la identificación rápida de cochinillas harinosas. Se amplificaron y secuenciaron los fragmentos del gen COI de 5 extremos de 12 especies de cochinillas harinosas. Además, se estableció un ensayo de mPCR para identificar tres especies comunes de cochinillas harinosas en Hainan, es decir, , , y . La optimización de las condiciones, la detección de la sensibilidad y los resultados de las pruebas de muestras de campo demuestran que el ensayo puede identificar las tres especies objetivo a través de una sola amplificación de PCR. Se puede detectar una concentración de ADN de muestra tan baja como 0.1-1 ng/L. Además, el ensayo junto con la secuenciación de códigos de barras puede identificar cochinillas harinosas recolectadas en el campo, aclarando la distribución y las plantas hospederas de 12 especies de cochinillas harinosas comúnmente encontradas en Hainan. Así, se realiza la identificación rápida de especies importantes de cochinillas harinosas. El establecimiento de esta tecnología proporciona una herramienta molecular económica y eficiente para la cuarentena y el monitoreo de cochinillas harinosas en Hainan y otras regiones, que son esenciales para la detección, monitoreo y alerta temprana de organismos invasores.