En la cirugía craneofacial reconstructiva, la simetría bilateral del plano medio del esqueleto facial juega un papel importante en la planificación quirúrgica. Los cirujanos pueden aprovechar el lado intacto de la cara como plantilla para el lado malformado al localizar con precisión el plano medio para ayudar en la preparación del procedimiento quirúrgico. Sin embargo, a pesar de su importancia, la ubicación de la línea media sigue siendo un procedimiento subjetivo. El objetivo de este estudio fue presentar una técnica 3D utilizando una red neuronal convolucional y momentos geométricos para calcular automáticamente la simetría de la línea media craneofacial del esqueleto facial a partir de escaneos de TC. Para realizar esta tarea, se evaluaron un total de 195 imágenes de cráneos para validar la técnica propuesta. En los planos de simetría, se encontró que la técnica era confiable y proporcionaba buena precisión. Sin embargo, se pueden llevar a cabo más investigaciones para mejorar los resultados de imágenes asimétricas.