El Sambar es una de las especies de ciervos más grandes distribuidas principalmente en Asia, y ha sido catalogado como una especie vulnerable. La taxonomía basada en la caracterización morfológica ha sido el método estándar utilizado para identificar la especie de ciervo Sambar. Sin embargo, la identificación morfológica es un desafío y requiere experiencia. Para llevar a cabo la identificación de especies y decisiones taxonómicas, realizamos la identificación molecular de ejemplares encontrados en Sri Lanka utilizando códigos de barras de ADN, y para comparar el Sambar de Sri Lanka con el indio y otras subespecies. Obtuvimos secuencias de ADN mitocondrial de muestras de sangre recolectadas de la zona húmeda en Sri Lanka. Se construyó un árbol filogenético basado en los análisis bayesianos utilizando MrBayes 3.2.7. La datación molecular se implementó en el Análisis Bayesiano Evolutivo de Muestreo de Árboles (BEAST v1.8.2) sobre la secuencia concatenada utilizando un reloj relajado log-normal y un árbol de especies de Yule, con cuatro categorías. Los resultados mostraron que el Sambar de Sri Lanka es genéticamente diferente del indio y otras subespecies. La divergencia ocurrió aproximadamente hace 1.1 MYA (millones de años) en la era del Pleistoceno. Los resultados son esenciales para diseñar nuevas plataformas de conservación para estas especies de ciervo Sambar.