Este artículo realiza un estudio detallado de un amplio conjunto de proxies organo-geológicos en 15 núcleos de sedimento recolectados de las principales cuencas del Lago Baikal (la del norte, la central y la del sur) donde se detectaron procesos de descarga de fluidos focalizados. Una variedad de zonas estudiadas incluye sitios con filtraciones de gas e hidrotermales, volcanes de barro con o sin descarga de fluidos de gas-petróleo, hidratos de gas y carbonatos autigénicos. La composición de la materia orgánica dispersa y los marcadores moleculares de hidrocarburos individuales (n-alcanos, alquenos dimetílicos, isoprenoides, esteroides, terpanos y hidrocarburos aromáticos policíclicos) atestiguan la entrada de fuentes terrestres alóctonas y fuentes microbianas y algales autóctonas. Las fuentes estudiadas, los parámetros de madurez y biodegradación de la materia orgánica varían significativamente para áreas con diferentes descargas de fluidos. La composición de biomarcadores específicos, incluidos los isoprenoides y hopanoides inmaduros, refleja los cambios laterales y verticales de la actividad microbiana en los sedimentos asociados con diversas condiciones ambientales. Los tipos identificados de distribución de terpanos (maduro, mixto e inmaduro) correlacionan bien con los tipos de descarga de fluidos y atestiguan el desarrollo de diversas comunidades microbianas metanogénicas y metanotróficas en los sedimentos. Además, la especificidad revelada de la distribución de marcadores moleculares microbianos nos permitió sugerir los procesos de descarga de fluidos en zonas donde no se habían detectado previamente.