Relaciones genéticas de 118 germoplasmas específicos y construcción de su identificación molecular basada en características morfológicas y marcadores SSR
Autores: Bai, Xiaoqian; Zhang, Shijie; Wang, Wu; Chen, Yu; Zhao, Yuqiang; Shi, Fenghou; Zhu, Cancan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Relaciones genéticas de 118 germoplasmas específicos y construcción de su identificación molecular basada en características morfológicas y marcadores SSR
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Relaciones genéticas
Rasgos fenotípicos
Marcadores SSR
Tarjetas de identidad molecular
Alelos
Genotipos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Para entender las relaciones genéticas de las especies, se midieron 16 rasgos fenotípicos, se analizaron marcadores de repeticiones de secuencia simple (SSR) y se construyeron tarjetas de identidad molecular (IDs) para 118 materiales utilizando electroforesis capilar fluorescente. Los valores del coeficiente de variación de los 16 rasgos morfológicos de los materiales de prueba variaron del 11.11% al 60.38%. Se detectaron un total de 58 alelos utilizando seis pares de cebadores centrales de SSR, con un número promedio de 9.7 alelos por locus. El número promedio de alelos válidos por locus fue de 3.9419 y la proporción de alelos válidos fue del 40.78%. Se detectaron un total de 105 genotipos, y el número de especies genotípicas que se podían amplificar por par de cebadores varió de 8 a 26. El valor medio de la heterocigosidad observada fue de 0.4986. La variación en los valores fue similar; el tamaño del valor fue aproximadamente 2.21 veces mayor, y su número medio de variaciones fue de 0.7390, 0.7359, 0.6985 y 1.6015, respectivamente. La clasificación de 118 especies se realizó utilizando tres métodos analíticos: análisis de estructura, análisis de agrupamiento por vecino más cercano (NJ) y análisis de coordenadas principales (PCoA), y los resultados de los tres métodos estuvieron en alta concordancia. Se utilizaron seis pares de cebadores centrales de SSR con alto polimorfismo y fuertes propiedades discriminatorias para identificar 118 plantas, y se construyó una tarjeta de ID molecular única para cada material. Estos resultados proporcionan información sobre la diversidad genética y la estructura poblacional de las plantas y una base teórica para mejorar el fenómeno de las variedades mixtas y las plantas de calidad inferior en el mercado de plantas.
Descripción
Para entender las relaciones genéticas de las especies, se midieron 16 rasgos fenotípicos, se analizaron marcadores de repeticiones de secuencia simple (SSR) y se construyeron tarjetas de identidad molecular (IDs) para 118 materiales utilizando electroforesis capilar fluorescente. Los valores del coeficiente de variación de los 16 rasgos morfológicos de los materiales de prueba variaron del 11.11% al 60.38%. Se detectaron un total de 58 alelos utilizando seis pares de cebadores centrales de SSR, con un número promedio de 9.7 alelos por locus. El número promedio de alelos válidos por locus fue de 3.9419 y la proporción de alelos válidos fue del 40.78%. Se detectaron un total de 105 genotipos, y el número de especies genotípicas que se podían amplificar por par de cebadores varió de 8 a 26. El valor medio de la heterocigosidad observada fue de 0.4986. La variación en los valores fue similar; el tamaño del valor fue aproximadamente 2.21 veces mayor, y su número medio de variaciones fue de 0.7390, 0.7359, 0.6985 y 1.6015, respectivamente. La clasificación de 118 especies se realizó utilizando tres métodos analíticos: análisis de estructura, análisis de agrupamiento por vecino más cercano (NJ) y análisis de coordenadas principales (PCoA), y los resultados de los tres métodos estuvieron en alta concordancia. Se utilizaron seis pares de cebadores centrales de SSR con alto polimorfismo y fuertes propiedades discriminatorias para identificar 118 plantas, y se construyó una tarjeta de ID molecular única para cada material. Estos resultados proporcionan información sobre la diversidad genética y la estructura poblacional de las plantas y una base teórica para mejorar el fenómeno de las variedades mixtas y las plantas de calidad inferior en el mercado de plantas.