La identificación molecular y el análisis filogenético de la especie (Orchidaceae) se basan en los posibles códigos de barras de ADN , , y el espaciador interno transcrito
Autores: Chen, Zhenming; Gao, Ling; Wang, Huizhong; Feng, Shangguo
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
La identificación molecular y el análisis filogenético de la especie (Orchidaceae) se basan en los posibles códigos de barras de ADN , , y el espaciador interno transcrito
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Especies
ADN
ITS
Filogenia
Códigos de barras
Análisis
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
Numerosas especies tienen un gran valor comercial a nivel global debido a sus exóticas flores ornamentales. La identificación de especies es desafiante debido a sus formas similares, lo que dificulta su uso racional y la conservación de los recursos de germoplasma. En el presente estudio, en primer lugar, se examinaron cuatro loci de plásmidos (, y ) y un locus nuclear (espaciador transcrito interno, ITS) para identificar especies. En segundo lugar, inferimos la filogenia interespecífica de las especies utilizando secuencias de ITS. Todas estas regiones de ADN, con la excepción de -, pudieron ser amplificadas fácilmente de , y las secuencias de ADN correspondientes pudieron obtenerse con éxito mediante secuenciación. Nuestra investigación demostró que ITS exhibió las mayores divergencias intra e interespecíficas, la mayor brecha de codificación de barras y la mayor proporción de identificación de especies. El análisis filogenético de especies basado en las regiones de ITS corroboró principalmente los resultados obtenidos mediante métodos morfológicos tradicionales. Un análisis comparativo de códigos de barras de ADN candidatos ha demostrado que el ITS puede ser utilizado no solo para la codificación de especies, sino también para el análisis filogenético de .
Descripción
Numerosas especies tienen un gran valor comercial a nivel global debido a sus exóticas flores ornamentales. La identificación de especies es desafiante debido a sus formas similares, lo que dificulta su uso racional y la conservación de los recursos de germoplasma. En el presente estudio, en primer lugar, se examinaron cuatro loci de plásmidos (, y ) y un locus nuclear (espaciador transcrito interno, ITS) para identificar especies. En segundo lugar, inferimos la filogenia interespecífica de las especies utilizando secuencias de ITS. Todas estas regiones de ADN, con la excepción de -, pudieron ser amplificadas fácilmente de , y las secuencias de ADN correspondientes pudieron obtenerse con éxito mediante secuenciación. Nuestra investigación demostró que ITS exhibió las mayores divergencias intra e interespecíficas, la mayor brecha de codificación de barras y la mayor proporción de identificación de especies. El análisis filogenético de especies basado en las regiones de ITS corroboró principalmente los resultados obtenidos mediante métodos morfológicos tradicionales. Un análisis comparativo de códigos de barras de ADN candidatos ha demostrado que el ITS puede ser utilizado no solo para la codificación de especies, sino también para el análisis filogenético de .