Identificación de la Población Genotípica Indígena Tailandesa mediante la Integración de Estudios Morfológicos y Moleculares
Autores: Chedao, Nusanisa; Pandey, Avinash Chandra; Suraninpong, Potjamarn
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación de la Población Genotípica Indígena Tailandesa mediante la Integración de Estudios Morfológicos y Moleculares
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Tropical
Delimitación de especies
Complejidad genética
Genotipificación AFLP
Perfilado de SSR
Codificación de cloroplastos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
, un género diverso dentro de la familia Lycopodiaceae, presenta una amplia diversidad en regiones tropicales, incluyendo Tailandia. La delimitación precisa de especies en el género de musgos de club tropical se ve desafiada por una alta plasticidad morfológica y complejidad genética. Este estudio aplicó un enfoque integrador de múltiples loci combinando análisis morfométrico de 27 especímenes completos, 35 accesiones para genotipificación AFLP (926 loci; PIC 0.32), perfilado SSR (44 loci; PIC 0.57; heterocigosidad esperada 0.35) y codificación de cloroplastos utilizando (1308 bp; bootstrap 89-99%) y el espaciador intergénico (308 bp; bootstrap >= 94%). Se identificaron un total de 13 como pertenecientes a siete especies conocidas, incluyendo (NST01, NST15, NST36), (JP04), (NST13), (PHI16), (NST21, NST22, MY31), (NST30) y (MY32, MY33, NST34). El agrupamiento morfológico y los marcadores moleculares distinguieron consistentemente las accesiones del grupo externo. Además, 19 accesiones previamente no clasificadas fueron identificadas con éxito como pertenecientes a las especies (NST23), (NST03, JP05, STN12, PNA14, SKA25, CPN26, KRB27, PNA28), (NWT07, STN08, NST09, NST10, PHI29), (NST17) y (PNA06, STN18, CPN19, JP24). Además, este estudio identificó tres linajes novedosos (NST02, STN11, NST20) con un fuerte apoyo a través de los conjuntos de datos. La combinación de una amplia cobertura genómica (AFLP), resolución alélica a escala fina (SSR), un respaldo de rama profunda () y discriminación de rama terminal (A-H) proporciona un marco robusto para la identificación de especies. Estos resultados definen unidades operativas claras para la priorización de la conservación y establecen una base para el desarrollo asistido por marcadores de cultivares ornamentales.
Descripción
, un género diverso dentro de la familia Lycopodiaceae, presenta una amplia diversidad en regiones tropicales, incluyendo Tailandia. La delimitación precisa de especies en el género de musgos de club tropical se ve desafiada por una alta plasticidad morfológica y complejidad genética. Este estudio aplicó un enfoque integrador de múltiples loci combinando análisis morfométrico de 27 especímenes completos, 35 accesiones para genotipificación AFLP (926 loci; PIC 0.32), perfilado SSR (44 loci; PIC 0.57; heterocigosidad esperada 0.35) y codificación de cloroplastos utilizando (1308 bp; bootstrap 89-99%) y el espaciador intergénico (308 bp; bootstrap >= 94%). Se identificaron un total de 13 como pertenecientes a siete especies conocidas, incluyendo (NST01, NST15, NST36), (JP04), (NST13), (PHI16), (NST21, NST22, MY31), (NST30) y (MY32, MY33, NST34). El agrupamiento morfológico y los marcadores moleculares distinguieron consistentemente las accesiones del grupo externo. Además, 19 accesiones previamente no clasificadas fueron identificadas con éxito como pertenecientes a las especies (NST23), (NST03, JP05, STN12, PNA14, SKA25, CPN26, KRB27, PNA28), (NWT07, STN08, NST09, NST10, PHI29), (NST17) y (PNA06, STN18, CPN19, JP24). Además, este estudio identificó tres linajes novedosos (NST02, STN11, NST20) con un fuerte apoyo a través de los conjuntos de datos. La combinación de una amplia cobertura genómica (AFLP), resolución alélica a escala fina (SSR), un respaldo de rama profunda () y discriminación de rama terminal (A-H) proporciona un marco robusto para la identificación de especies. Estos resultados definen unidades operativas claras para la priorización de la conservación y establecen una base para el desarrollo asistido por marcadores de cultivares ornamentales.