Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes y su respuesta a estrés abiótico en
Autores: Tan, Zhengwei; Lu, Dandan; Yu, Yongliang; Li, Lei; Dong, Wei; Xu, Lanjie; Yang, Qing; Wan, Xiufu; Liang, Huizhen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación y caracterización a nivel genómico de la familia de genes y su respuesta a estrés abiótico en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Genes
Crecimiento y desarrollo
Relaciones filogenéticas
Elementos cis-actuantes del promotor
Estrés abiótico y biótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción básicos de hélice-bucle-hélice (bHLH) poseen dominios de unión al ADN y de dimerización, y están involucrados en varios procesos biológicos y fisiológicos, como el crecimiento y desarrollo, la regulación de metabolitos secundarios y la respuesta al estrés. Sin embargo, la familia de genes no ha sido investigada. En este estudio, realizamos una identificación y análisis a nivel genómico de los factores de transcripción bHLH. Se identificaron un total de 120 genes, distribuidos en los 12 cromosomas, y clasificados en 24 subfamilias según sus relaciones filogenéticas. Además, los 120 genes fueron sometidos a análisis exhaustivos, incluyendo alineación de secuencias de proteínas, evaluación evolutiva, predicción de motivos y análisis de elementos cis-actuantes en los promotores. El análisis de la región del promotor reveló que los genes abarcan elementos cis-actuantes y están asociados con varios aspectos del crecimiento y desarrollo de las plantas, respuestas a fitohormonas, así como respuestas a estreses abióticos y bióticos. Los perfiles de expresión, obtenidos de bases de datos de transcriptomas, indicaron patrones de expresión distintos entre estos genes, que parecían ser específicos de tejidos o de ciertos cultivares. Para explorar más a fondo su funcionalidad, determinamos los niveles de expresión de quince genes conocidos por albergar motivos relacionados con respuestas abióticas y hormonales. Esta investigación abarcó tratamientos con ABA, sal, sequía y MeJA. Los resultados demostraron variaciones sustanciales en los patrones de expresión de los genes en respuesta a estos tratamientos abióticos y hormonales. En resumen, nuestro estudio establece una base sólida para futuras investigaciones sobre los roles y mecanismos regulatorios de la familia de genes.
Descripción
Los factores de transcripción básicos de hélice-bucle-hélice (bHLH) poseen dominios de unión al ADN y de dimerización, y están involucrados en varios procesos biológicos y fisiológicos, como el crecimiento y desarrollo, la regulación de metabolitos secundarios y la respuesta al estrés. Sin embargo, la familia de genes no ha sido investigada. En este estudio, realizamos una identificación y análisis a nivel genómico de los factores de transcripción bHLH. Se identificaron un total de 120 genes, distribuidos en los 12 cromosomas, y clasificados en 24 subfamilias según sus relaciones filogenéticas. Además, los 120 genes fueron sometidos a análisis exhaustivos, incluyendo alineación de secuencias de proteínas, evaluación evolutiva, predicción de motivos y análisis de elementos cis-actuantes en los promotores. El análisis de la región del promotor reveló que los genes abarcan elementos cis-actuantes y están asociados con varios aspectos del crecimiento y desarrollo de las plantas, respuestas a fitohormonas, así como respuestas a estreses abióticos y bióticos. Los perfiles de expresión, obtenidos de bases de datos de transcriptomas, indicaron patrones de expresión distintos entre estos genes, que parecían ser específicos de tejidos o de ciertos cultivares. Para explorar más a fondo su funcionalidad, determinamos los niveles de expresión de quince genes conocidos por albergar motivos relacionados con respuestas abióticas y hormonales. Esta investigación abarcó tratamientos con ABA, sal, sequía y MeJA. Los resultados demostraron variaciones sustanciales en los patrones de expresión de los genes en respuesta a estos tratamientos abióticos y hormonales. En resumen, nuestro estudio establece una base sólida para futuras investigaciones sobre los roles y mecanismos regulatorios de la familia de genes.