Identificación a nivel genómico y perfil de expresión de los genes de la proteína relacionada con la patogénesis 1 () en trigo duro (Desf.)
Autores: Zribi, Ikram; Ghorbel, Mouna; Haddaji, Najla; Besbes, Malek; Brini, Faiçal
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a nivel genómico y perfil de expresión de los genes de la proteína relacionada con la patogénesis 1 () en trigo duro (Desf.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Patógeno
Proteínas
Respuesta de la planta
Estrés abiótico
Familia de genes
Trigo duro
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Las proteínas relacionadas con patógenos (PRs) son proteínas diversificadas con un bajo peso molecular implicadas en la respuesta de las plantas al estrés biótico y abiótico, así como en la regulación de diferentes funciones en la maduración de las plantas. Curiosamente, no se ha realizado un estudio sistemático en el trigo duro (subsp.). En el presente estudio, se identificaron dominios que codifican una superfamilia CAP en el genoma de subsp., que es un cereal importante, utilizando enfoques in silico. Además, el análisis filogenético mostró que los genes se clasificaron en tres grupos según su punto isoeléctrico y el dominio de motivo conservado. Además, nuestro análisis mostró que la mayoría de las proteínas TdPR-1 presentaban un péptido señal N-terminal. El análisis de patrones de expresión mostró que la familia de genes presentaba especificidad temporal y espacial y fue inducida por diferentes estreses abióticos. Este es el primer informe que describe el análisis a escala genómica de la familia de genes del trigo duro, y estos datos ayudarán a estudiar más a fondo los roles de los genes durante las respuestas al estrés, lo que conducirá a la mejora de los cultivos.
Descripción
Las proteínas relacionadas con patógenos (PRs) son proteínas diversificadas con un bajo peso molecular implicadas en la respuesta de las plantas al estrés biótico y abiótico, así como en la regulación de diferentes funciones en la maduración de las plantas. Curiosamente, no se ha realizado un estudio sistemático en el trigo duro (subsp.). En el presente estudio, se identificaron dominios que codifican una superfamilia CAP en el genoma de subsp., que es un cereal importante, utilizando enfoques in silico. Además, el análisis filogenético mostró que los genes se clasificaron en tres grupos según su punto isoeléctrico y el dominio de motivo conservado. Además, nuestro análisis mostró que la mayoría de las proteínas TdPR-1 presentaban un péptido señal N-terminal. El análisis de patrones de expresión mostró que la familia de genes presentaba especificidad temporal y espacial y fue inducida por diferentes estreses abióticos. Este es el primer informe que describe el análisis a escala genómica de la familia de genes del trigo duro, y estos datos ayudarán a estudiar más a fondo los roles de los genes durante las respuestas al estrés, lo que conducirá a la mejora de los cultivos.