Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes en Trigo y Su Análisis de Expresión en Respuesta al Estrés Salino
Autores: Li, Xuqing; Liu, Shuotong; Yu, Pei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes en Trigo y Su Análisis de Expresión en Respuesta al Estrés Salino
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Trigo
Familia de genes
Respuestas al estrés
Estrés salino
Enzimas ligasas de ubiquitina
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
El trigo es uno de los cultivos de cereales más importantes a nivel mundial, con un valor económico significativo. La familia de genes Tóxicos en Levadura de Arabidopsis, que comprende miembros de las enzimas ligasas de ubiquitina (E3), funciona en el etiquetado de proteínas sustrato durante la modificación de proteínas mediada por ubiquitina. Estudios recientes han demostrado su participación en respuestas al estrés. Sin embargo, la familia de genes en el trigo sigue estando poco caracterizada. Este estudio tuvo como objetivo identificar los miembros de la familia de genes en el trigo e investigar sus roles bajo estrés salino. Identificamos 334 genes en el genoma del trigo, todos los cuales contienen dominios de superfamilia RING-H2, RING U-box o RAD18, exhibiendo una proporción notablemente baja de genes que contienen intrones. El análisis de la tasa de sustitución Ka/Ks (no sinónima a sinónima) y el análisis de elementos reguladores de la familia de genes indican que sus secuencias son altamente conservadas y funcionalmente restringidas, sugiriendo que pueden participar en respuestas al estrés abiótico a través de las vías de señalización ABA, MeJA y MYB. Tanto el análisis de RNA-seq como los datos de RT-qPCR demostraron que los niveles de expresión de la familia de genes estaban significativamente regulados al alza bajo condiciones de estrés, indicando sus roles cruciales en las respuestas al estrés. Este estudio demuestra que la regulación dirigida de las vías de señalización responsables de la respuesta al estrés mediadas por miembros superiores de la familia de genes puede mejorar efectivamente la tolerancia al estrés salino en el trigo, proporcionando así una estrategia viable para el desarrollo de cultivares de alto rendimiento adaptados a ecosistemas agrícolas salinos.
Descripción
El trigo es uno de los cultivos de cereales más importantes a nivel mundial, con un valor económico significativo. La familia de genes Tóxicos en Levadura de Arabidopsis, que comprende miembros de las enzimas ligasas de ubiquitina (E3), funciona en el etiquetado de proteínas sustrato durante la modificación de proteínas mediada por ubiquitina. Estudios recientes han demostrado su participación en respuestas al estrés. Sin embargo, la familia de genes en el trigo sigue estando poco caracterizada. Este estudio tuvo como objetivo identificar los miembros de la familia de genes en el trigo e investigar sus roles bajo estrés salino. Identificamos 334 genes en el genoma del trigo, todos los cuales contienen dominios de superfamilia RING-H2, RING U-box o RAD18, exhibiendo una proporción notablemente baja de genes que contienen intrones. El análisis de la tasa de sustitución Ka/Ks (no sinónima a sinónima) y el análisis de elementos reguladores de la familia de genes indican que sus secuencias son altamente conservadas y funcionalmente restringidas, sugiriendo que pueden participar en respuestas al estrés abiótico a través de las vías de señalización ABA, MeJA y MYB. Tanto el análisis de RNA-seq como los datos de RT-qPCR demostraron que los niveles de expresión de la familia de genes estaban significativamente regulados al alza bajo condiciones de estrés, indicando sus roles cruciales en las respuestas al estrés. Este estudio demuestra que la regulación dirigida de las vías de señalización responsables de la respuesta al estrés mediadas por miembros superiores de la familia de genes puede mejorar efectivamente la tolerancia al estrés salino en el trigo, proporcionando así una estrategia viable para el desarrollo de cultivares de alto rendimiento adaptados a ecosistemas agrícolas salinos.