Una identificación a nivel del genoma y patrón de expresión de la familia de genes de Nabo (L.) bajo diversas tensiones abióticas
Autores: Khan, Waqar; El-Shehawi, Ahmed M.; Ali, Fayaz; Ali, Murad; Alqurashi, Mohammed; Althaqafi, Mohammed M.; Alharthi, Siraj B.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Una identificación a nivel del genoma y patrón de expresión de la familia de genes de Nabo (L.) bajo diversas tensiones abióticas
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Multi-cobre oxidasas
Familia de genes LMCO
Estrés abiótico
Genes Br-Lac
Estructura genética
Características evolutivas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
Las oxidasas multi-cobre similares a la lacasa (LMCOs) son un grupo de enzimas involucradas en la oxidación de numerosos sustratos. Recientemente, estas enzimas se han vuelto extremadamente populares debido a sus aplicaciones prácticas en varios campos de la biología. Las LMCOs generalmente oxidan varios sustratos al vincular la reducción de cuatro electrones del aceptador final, el oxígeno molecular (O), con agua. Las oxidasas multi-cobre relacionadas con la lacasa están ampliamente distribuidas como familias de múltiples genes en las secuencias genómicas de las plantas superiores. El estudio actual investigó a fondo la familia de genes LMCO (Br-Lac) y su patrón de expresión bajo diversas tensiones abióticas en L. Se identificaron un total de 18 miembros de la familia de genes Br-Lac ubicados en cinco cromosomas diferentes. El análisis filogenético clasificó los genes Br-Lac documentados en siete grupos: Grupo-I (cuatro genes), Grupo-II (nueve genes), Grupo-III (ocho genes), Grupo-IV (cuatro genes), Grupo-V (seis genes) y Grupo-VI y Grupo-VII (un gen cada uno). Las características clave de la estructura del gen y los motivos responsivos compartieron la mayor semejanza dentro de los mismos grupos. Además, un estudio de divergencia también evaluó las características evolutivas de los genes Br-Lac. El período anticipado de divergencia osciló entre 12.365 y 39.250 MYA (millones de años atrás). También identificamos el papel fundamental de los 18 miembros documentados de la familia de genes LMCO (Br-lac) utilizando qRT-PCR cuantitativa en tiempo real. Br-Lac-6, Br-Lac-7, Br-Lac-8, Br-Lac-16, Br-Lac-17 y Br-Lac-22 respondieron positivamente a las tensiones abióticas (es decir, sequía, calor y salinidad). Estos hallazgos preparan el terreno para la diversidad funcional de los genes LMCO en .
Descripción
Las oxidasas multi-cobre similares a la lacasa (LMCOs) son un grupo de enzimas involucradas en la oxidación de numerosos sustratos. Recientemente, estas enzimas se han vuelto extremadamente populares debido a sus aplicaciones prácticas en varios campos de la biología. Las LMCOs generalmente oxidan varios sustratos al vincular la reducción de cuatro electrones del aceptador final, el oxígeno molecular (O), con agua. Las oxidasas multi-cobre relacionadas con la lacasa están ampliamente distribuidas como familias de múltiples genes en las secuencias genómicas de las plantas superiores. El estudio actual investigó a fondo la familia de genes LMCO (Br-Lac) y su patrón de expresión bajo diversas tensiones abióticas en L. Se identificaron un total de 18 miembros de la familia de genes Br-Lac ubicados en cinco cromosomas diferentes. El análisis filogenético clasificó los genes Br-Lac documentados en siete grupos: Grupo-I (cuatro genes), Grupo-II (nueve genes), Grupo-III (ocho genes), Grupo-IV (cuatro genes), Grupo-V (seis genes) y Grupo-VI y Grupo-VII (un gen cada uno). Las características clave de la estructura del gen y los motivos responsivos compartieron la mayor semejanza dentro de los mismos grupos. Además, un estudio de divergencia también evaluó las características evolutivas de los genes Br-Lac. El período anticipado de divergencia osciló entre 12.365 y 39.250 MYA (millones de años atrás). También identificamos el papel fundamental de los 18 miembros documentados de la familia de genes LMCO (Br-lac) utilizando qRT-PCR cuantitativa en tiempo real. Br-Lac-6, Br-Lac-7, Br-Lac-8, Br-Lac-16, Br-Lac-17 y Br-Lac-22 respondieron positivamente a las tensiones abióticas (es decir, sequía, calor y salinidad). Estos hallazgos preparan el terreno para la diversidad funcional de los genes LMCO en .