Identificación genómica de la familia de genes de la sintasa de calosa () en sorgo () y análisis comparativo de expresión in silico bajo infestación de áfidos ()
Autores: Zou, Kunliang; Liu, Yang; Wang, Tonghan; Guan, Minghui; Li, Xiaofei; Li, Jieqin; Yu, Haibing; Wu, Degong; Du, Junli
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación genómica de la familia de genes de la sintasa de calosa () en sorgo () y análisis comparativo de expresión in silico bajo infestación de áfidos ()
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Callosa
Sintasa
Sorgo
Genes
Resistencia
áfidos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 19
Citaciones: Sin citaciones
El caloso está ampliamente presente en plantas superiores y desempeña un papel significativo en el crecimiento, desarrollo y respuesta de las plantas a diversos factores de estrés. Aunque numerosos estudios han destacado la importancia de los genes de la sintasa de caloso, su papel en la resistencia del sorgo a los pulgones sigue siendo limitadamente entendido. Este estudio identificó 11 genes de sintasa de caloso de sorgo, distribuidos de manera desigual en cuatro cromosomas del sorgo. Todas las proteínas SbCalS contienen dominios de sintasa de glucano y Fks1, con la duplicación segmentaria desempeñando un papel importante en la diversificación génica. La predicción de elementos cis reveló la presencia de numerosos elementos de respuesta al estrés, lo que indica que esta familia de genes está principalmente involucrada en la resistencia al estrés. Utilizando datos de ARN-seq publicados, descubrimos la expresión diferencial del gen entre variedades de sorgo resistentes y susceptibles. El análisis de PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) confirmó los niveles de expresión relativos de todos los miembros bajo estrés de pulgones. Para verificar aún más el papel del caloso en el sorgo, medimos el contenido de caloso en ambas variedades de sorgo resistentes y susceptibles. Los resultados indicaron que el caloso desempeña un papel crítico en la resistencia a los pulgones en el sorgo, particularmente el gen. Este estudio proporciona una referencia para una mayor investigación sobre el papel de los genes de sintasa de caloso en la resistencia del sorgo a los pulgones.
Descripción
El caloso está ampliamente presente en plantas superiores y desempeña un papel significativo en el crecimiento, desarrollo y respuesta de las plantas a diversos factores de estrés. Aunque numerosos estudios han destacado la importancia de los genes de la sintasa de caloso, su papel en la resistencia del sorgo a los pulgones sigue siendo limitadamente entendido. Este estudio identificó 11 genes de sintasa de caloso de sorgo, distribuidos de manera desigual en cuatro cromosomas del sorgo. Todas las proteínas SbCalS contienen dominios de sintasa de glucano y Fks1, con la duplicación segmentaria desempeñando un papel importante en la diversificación génica. La predicción de elementos cis reveló la presencia de numerosos elementos de respuesta al estrés, lo que indica que esta familia de genes está principalmente involucrada en la resistencia al estrés. Utilizando datos de ARN-seq publicados, descubrimos la expresión diferencial del gen entre variedades de sorgo resistentes y susceptibles. El análisis de PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) confirmó los niveles de expresión relativos de todos los miembros bajo estrés de pulgones. Para verificar aún más el papel del caloso en el sorgo, medimos el contenido de caloso en ambas variedades de sorgo resistentes y susceptibles. Los resultados indicaron que el caloso desempeña un papel crítico en la resistencia a los pulgones en el sorgo, particularmente el gen. Este estudio proporciona una referencia para una mayor investigación sobre el papel de los genes de sintasa de caloso en la resistencia del sorgo a los pulgones.