Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión de la Familia de Genes Responsivos a Auxina en Pimiento (L.)
Autores: Zang, Qiao-Lu; Wang, Meng; Liu, Lu; Zheng, Xiao-Mei; Cheng, Yan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Identificación a Nivel Genómico y Análisis de Expresión de la Familia de Genes Responsivos a Auxina en Pimiento (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Auxina
Familia de genes
Pimiento
Estrés
Respuesta
Hormonas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Como un gen responsable de la auxina, () mantiene la homeostasis hormonal al conjugar el exceso de auxina con aminoácidos en las vías de señalización relacionadas con el estrés en las plantas. Se han caracterizado genes en muchas especies de plantas, pero las características de los miembros de la familia de genes de pimiento (L.) () en respuesta a múltiples estimulantes son en gran medida desconocidas. En este estudio, identificamos sistemáticamente la familia de genes a nivel genómico e identificamos ocho miembros en cuatro cromosomas en pimiento. Los s se dividieron en dos grupos (I y III) y compartieron motivos, dominios y estructuras de genes conservados. Además, los s tenían relaciones evolutivas cercanas con el tomate (L.), y los promotores de la mayoría de los genes contenían elementos de respuesta a hormonas y estrés abiótico. Un análisis de predicción de interacción de proteínas demostró que las proteínas CaGH3-3/3-6/3-7/3-8 eran posiblemente miembros centrales de la interacción familiar. Además, los resultados de qRT-PCR mostraron que los genes se expresaron diferencialmente en los tejidos de pimiento y podían ser inducidos por fitohormonas (IAA, ABA y MeJA) y estrés abiótico (sal, baja temperatura y sequía) con diferentes patrones. Además, y fueron clonados, y las secuencias mostraron un alto grado de conservación. Además, los resultados de la localización subcelular indicaron que estaban ubicados en la membrana y en el cloroplasto. Notablemente, después de la sobreexpresión en tomate, se realizó un RNA-seq en líneas silvestres y transgénicas, y los genes expresados diferencialmente se enriquecieron principalmente en respuesta a estímulos externos. Este estudio no solo sienta las bases para una comprensión integral de la función de la familia de genes durante el crecimiento de las plantas y las respuestas al estrés, sino que también proporciona recursos genéticos potenciales para la mejora de la resistencia del pimiento.
Descripción
Como un gen responsable de la auxina, () mantiene la homeostasis hormonal al conjugar el exceso de auxina con aminoácidos en las vías de señalización relacionadas con el estrés en las plantas. Se han caracterizado genes en muchas especies de plantas, pero las características de los miembros de la familia de genes de pimiento (L.) () en respuesta a múltiples estimulantes son en gran medida desconocidas. En este estudio, identificamos sistemáticamente la familia de genes a nivel genómico e identificamos ocho miembros en cuatro cromosomas en pimiento. Los s se dividieron en dos grupos (I y III) y compartieron motivos, dominios y estructuras de genes conservados. Además, los s tenían relaciones evolutivas cercanas con el tomate (L.), y los promotores de la mayoría de los genes contenían elementos de respuesta a hormonas y estrés abiótico. Un análisis de predicción de interacción de proteínas demostró que las proteínas CaGH3-3/3-6/3-7/3-8 eran posiblemente miembros centrales de la interacción familiar. Además, los resultados de qRT-PCR mostraron que los genes se expresaron diferencialmente en los tejidos de pimiento y podían ser inducidos por fitohormonas (IAA, ABA y MeJA) y estrés abiótico (sal, baja temperatura y sequía) con diferentes patrones. Además, y fueron clonados, y las secuencias mostraron un alto grado de conservación. Además, los resultados de la localización subcelular indicaron que estaban ubicados en la membrana y en el cloroplasto. Notablemente, después de la sobreexpresión en tomate, se realizó un RNA-seq en líneas silvestres y transgénicas, y los genes expresados diferencialmente se enriquecieron principalmente en respuesta a estímulos externos. Este estudio no solo sienta las bases para una comprensión integral de la función de la familia de genes durante el crecimiento de las plantas y las respuestas al estrés, sino que también proporciona recursos genéticos potenciales para la mejora de la resistencia del pimiento.