Identificación a Nivel Genómico de los Miembros de la Familia NRT1 y Su Expresión bajo Condiciones de Bajo Nitrato en Repollo Chino (L. ssp.)
Autores: Zhang, Yihui; Ritonga, Faujiah Nurhasanah; Zhang, Shu; Wang, Fengde; Li, Jingjuan; Gao, Jianwei
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a Nivel Genómico de los Miembros de la Familia NRT1 y Su Expresión bajo Condiciones de Bajo Nitrato en Repollo Chino (L. ssp.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Transportadores de nitratos
Col china
Familia de genes
Perfil de expresión
Estructura del gen
Motivos conservados
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los transportadores de nitrato (NRTs) absorben y transforman activamente el nitrato (N) para formar una gran familia con muchos miembros y funciones distintas en el crecimiento y desarrollo de las plantas. Sin embargo, pocos estudios los han identificado en el contexto de bajas concentraciones de nitrato en el repollo chino (L. ssp.), un vegetal importante en China. Este estudio se centra en la identificación y análisis de la familia de genes del transportador de nitrato 1 (NRT1), así como en varios aspectos, incluyendo su distribución filogenética, posición cromosómica, estructura del gen, motivos conservados y patrón de duplicación. Utilizando métodos bioinformáticos, identificamos y analizamos 84 genes distribuidos en diez cromosomas. Además, realizamos un análisis del perfil de expresión del gen NRT1 en varios tejidos del repollo chino expuestos a diferentes concentraciones de nitrato. Un análisis filogenético reveló que los miembros están distribuidos en seis grupos distintos. Basado en un análisis de la estructura del gen y los motivos conservados, se puede inferir que exhibe un patrón estructural generalmente conservado. Se descubrió que los promotores contenían elementos moosefs (MFS), lo que sugiere su posible papel en la regulación del transporte de NO a través de la membrana celular en el repollo chino. Un estudio de transcriptoma y un posterior análisis de RT-qPCR revelaron que los patrones de expresión de algunos genes eran específicos de tejidos concretos. Esta observación implica que estos genes pueden contribuir a la absorción y transporte de nitrato en varios tejidos u órganos. Los resultados ofrecen información fundamental para investigar la familia de genes en el repollo chino. Estos resultados proporcionan información básica para futuras investigaciones sobre la caracterización funcional de los genes en el repollo chino y la elucidación de los mecanismos moleculares subyacentes a la tolerancia a bajas concentraciones de nitrógeno en el repollo chino.
Descripción
Los transportadores de nitrato (NRTs) absorben y transforman activamente el nitrato (N) para formar una gran familia con muchos miembros y funciones distintas en el crecimiento y desarrollo de las plantas. Sin embargo, pocos estudios los han identificado en el contexto de bajas concentraciones de nitrato en el repollo chino (L. ssp.), un vegetal importante en China. Este estudio se centra en la identificación y análisis de la familia de genes del transportador de nitrato 1 (NRT1), así como en varios aspectos, incluyendo su distribución filogenética, posición cromosómica, estructura del gen, motivos conservados y patrón de duplicación. Utilizando métodos bioinformáticos, identificamos y analizamos 84 genes distribuidos en diez cromosomas. Además, realizamos un análisis del perfil de expresión del gen NRT1 en varios tejidos del repollo chino expuestos a diferentes concentraciones de nitrato. Un análisis filogenético reveló que los miembros están distribuidos en seis grupos distintos. Basado en un análisis de la estructura del gen y los motivos conservados, se puede inferir que exhibe un patrón estructural generalmente conservado. Se descubrió que los promotores contenían elementos moosefs (MFS), lo que sugiere su posible papel en la regulación del transporte de NO a través de la membrana celular en el repollo chino. Un estudio de transcriptoma y un posterior análisis de RT-qPCR revelaron que los patrones de expresión de algunos genes eran específicos de tejidos concretos. Esta observación implica que estos genes pueden contribuir a la absorción y transporte de nitrato en varios tejidos u órganos. Los resultados ofrecen información fundamental para investigar la familia de genes en el repollo chino. Estos resultados proporcionan información básica para futuras investigaciones sobre la caracterización funcional de los genes en el repollo chino y la elucidación de los mecanismos moleculares subyacentes a la tolerancia a bajas concentraciones de nitrógeno en el repollo chino.