Análisis de identificación a nivel genómico y perfil evolutivo de la familia de genes GDSL en manzana ( x )
Autores: Yuan, Jiawei; Liang, Zhejun; Wang, Lu; Chang, Fangjuan; Chen, Mengni; Dong, Peng; Zhang, Jian; Li, Yaoyao; Wang, Hui; Zhang, Zhanbei; Zhang, Xiaoling; Li, Yongshan; Miao, Tong; Zhang, Jiancheng
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
Análisis de identificación a nivel genómico y perfil evolutivo de la familia de genes GDSL en manzana ( x )
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Gdsl lipasa
Crecimiento de plantas
Estrés ambiental
Identificación a nivel genómico
Mdgdsls
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 25
Citaciones: Sin citaciones
Antecedentes/Objetivos: La lipasa GDSL es crucial para el crecimiento de las plantas y la respuesta al estrés ambiental. Aunque se han identificado familias de genes GDSL en algunas plantas, falta una identificación y análisis exhaustivos a nivel genómico. Métodos: En este estudio, identificamos 131 MdGDSLs pertenecientes a cuatro subfamilias, distribuidas en 17 cromosomas en el genoma. Resultados: Los pesos moleculares (MWs) de estos MdGDSLs van desde 14.44 hasta 83.26 kDa, con puntos isoeléctricos (PI) que van desde 4.32 hasta 10.09. Los miembros dentro del mismo subgrupo presentan estructuras génicas similares y motivos conservados. Además, la duplicación de genoma completo (WGD) contribuye significativamente a la evolución de la familia de genes MdGDSL. Las regiones promotoras de los genes MdGDSL contienen numerosos cis-elementos asociados con el estrés abiótico y respuestas hormonales. Además, los datos de RNA-seq indican que los genes MdGDSL responden a altas concentraciones de CaCl y tratamientos de estrés por frío. Conclusiones: Este estudio proporciona una base teórica para una investigación adicional sobre los mecanismos subyacentes al crecimiento, desarrollo y metabolismo de lípidos en respuesta al estrés en .
Descripción
Antecedentes/Objetivos: La lipasa GDSL es crucial para el crecimiento de las plantas y la respuesta al estrés ambiental. Aunque se han identificado familias de genes GDSL en algunas plantas, falta una identificación y análisis exhaustivos a nivel genómico. Métodos: En este estudio, identificamos 131 MdGDSLs pertenecientes a cuatro subfamilias, distribuidas en 17 cromosomas en el genoma. Resultados: Los pesos moleculares (MWs) de estos MdGDSLs van desde 14.44 hasta 83.26 kDa, con puntos isoeléctricos (PI) que van desde 4.32 hasta 10.09. Los miembros dentro del mismo subgrupo presentan estructuras génicas similares y motivos conservados. Además, la duplicación de genoma completo (WGD) contribuye significativamente a la evolución de la familia de genes MdGDSL. Las regiones promotoras de los genes MdGDSL contienen numerosos cis-elementos asociados con el estrés abiótico y respuestas hormonales. Además, los datos de RNA-seq indican que los genes MdGDSL responden a altas concentraciones de CaCl y tratamientos de estrés por frío. Conclusiones: Este estudio proporciona una base teórica para una investigación adicional sobre los mecanismos subyacentes al crecimiento, desarrollo y metabolismo de lípidos en respuesta al estrés en .