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Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes de la Ligasa de Ubiquitina E3 U-Box en Repollo (var.) y su Análisis de Expresión en Respuesta al Estrés Frío y a la Infección por Patógenos

Autores: Wang, Peiwen; Zhu, Lin; Li, Ziheng; Cheng, Mozhen; Chen, Xiuling; Wang, Aoxue; Wang, Chao; Zhang, Xiaoxuan

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes de la Ligasa de Ubiquitina E3 U-Box en Repollo (var.) y su Análisis de Expresión en Respuesta al Estrés Frío y a la Infección por Patógenos


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Ligasas de ubiquitina
Repollo
Genes
Crecimiento
Respuestas al estrés
Análisis filogenético

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 9

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las ligasas de ubiquitina E3 de U-box (PUBs) de las plantas juegan un papel importante en el crecimiento, desarrollo y respuestas al estrés en muchas especies. Sin embargo, las características de los genes de ligasa de ubiquitina E3 de U-box en la col (var.) aún no están claras. Aquí, llevamos a cabo un análisis a nivel genómico de los genes de ligasa de ubiquitina E3 de U-box en la col e identificamos 65 genes de ligasa de ubiquitina E3 de U-box (BoPUB) en el genoma de la col. El análisis filogenético indica que los 65 genes se agrupan en seis subfamilias, cuyos miembros son relativamente conservados en el dominio proteico y la estructura de exón-intrón. La localización cromosómica y los análisis de sintecnía muestran que los eventos de duplicación segmentaria y en tándem contribuyen a la expansión de la familia de genes de ligasa de ubiquitina E3 de U-box en la col. La predicción de interacción proteica presenta que puede ocurrir heterodimerización en las proteínas BoPUB. El análisis in silico del promotor y el perfil de expresión espaciotemporal de los genes revelan su participación en la respuesta a la luz, la respuesta a fitohormonas y el crecimiento y desarrollo. Además, encontramos que los genes participan en la biosíntesis de cera cuticular y en la respuesta al estrés por frío y ataque patógeno. Nuestros hallazgos proporcionan una profunda comprensión de la familia de genes de ligasa de ubiquitina E3 de U-box en la col y sientan las bases para el análisis funcional posterior de los genes en diferentes procesos biológicos.

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