Identificación a Nivel Genómico de Factores de Transcripción bZIP en y Análisis de Su Expresión Bajo Estrés por Baja Temperatura
Autores: Lai, Huiping; Wang, Mengyao; Yan, Lu; Feng, Caiyun; Tian, Yang; Tian, Xinyue; Peng, Donghui; Lan, Siren; Zhang, Yanping; Ai, Ye
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel Genómico de Factores de Transcripción bZIP en y Análisis de Su Expresión Bajo Estrés por Baja Temperatura
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Factores de transcripción
Crecimiento de plantas
Expresión génica
árbol filogenético
Respuesta al estrés
Estrés por bajas temperaturas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 11
Citaciones: Sin citaciones
Los factores de transcripción de la cremallera de leucina básica (bZIP) constituyen la familia eucariota más ampliamente distribuida y conservada. Desempeñan roles cruciales en el crecimiento, desarrollo y respuestas de las plantas tanto a estrés biótico como abiótico, ejerciendo un fuerte control regulador sobre la expresión de los genes descendentes. En este estudio, se llevó a cabo una caracterización a nivel genómico de la familia de factores de transcripción CebZIP utilizando análisis bioinformático. Se analizaron a fondo varios aspectos, incluyendo propiedades fisicoquímicas, filogenética, dominios estructurales conservados, estructuras génicas, distribución cromosómica, relaciones de covarianza génica, elementos reguladores y patrones de expresión génica. Se identificaron un total de 70 genes del genoma, que se distribuyeron aleatoriamente en 18 cromosomas. El árbol filogenético los agrupó en 11 subfamilias, cada una exhibiendo estructuras génicas complejas y motivos conservados dispuestos en un orden específico. Se identificaron diecinueve pares de genes duplicados entre los 70 genes, con dieciséis pares afectados por selección purificadora. El análisis de elementos reguladores reveló una plétora de elementos regulatorios asociados con la respuesta al estrés, hormonas vegetales y crecimiento y desarrollo de las plantas. Los resultados del transcriptoma y qRT-PCR demostraron que la expresión de los genes se reguló universalmente al alza bajo condiciones de baja temperatura. Sin embargo, los patrones de expresión variaron entre los diferentes miembros. Este estudio proporciona referencias teóricas para identificar genes clave que confieren resistencia al estrés por bajas temperaturas y sienta las bases para investigaciones futuras sobre sus funciones biológicas más amplias.
Descripción
Los factores de transcripción de la cremallera de leucina básica (bZIP) constituyen la familia eucariota más ampliamente distribuida y conservada. Desempeñan roles cruciales en el crecimiento, desarrollo y respuestas de las plantas tanto a estrés biótico como abiótico, ejerciendo un fuerte control regulador sobre la expresión de los genes descendentes. En este estudio, se llevó a cabo una caracterización a nivel genómico de la familia de factores de transcripción CebZIP utilizando análisis bioinformático. Se analizaron a fondo varios aspectos, incluyendo propiedades fisicoquímicas, filogenética, dominios estructurales conservados, estructuras génicas, distribución cromosómica, relaciones de covarianza génica, elementos reguladores y patrones de expresión génica. Se identificaron un total de 70 genes del genoma, que se distribuyeron aleatoriamente en 18 cromosomas. El árbol filogenético los agrupó en 11 subfamilias, cada una exhibiendo estructuras génicas complejas y motivos conservados dispuestos en un orden específico. Se identificaron diecinueve pares de genes duplicados entre los 70 genes, con dieciséis pares afectados por selección purificadora. El análisis de elementos reguladores reveló una plétora de elementos regulatorios asociados con la respuesta al estrés, hormonas vegetales y crecimiento y desarrollo de las plantas. Los resultados del transcriptoma y qRT-PCR demostraron que la expresión de los genes se reguló universalmente al alza bajo condiciones de baja temperatura. Sin embargo, los patrones de expresión variaron entre los diferentes miembros. Este estudio proporciona referencias teóricas para identificar genes clave que confieren resistencia al estrés por bajas temperaturas y sienta las bases para investigaciones futuras sobre sus funciones biológicas más amplias.