Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes y Análisis de Expresión Bajo Estrés por Baja Temperatura en el Plátano
Autores: Fan, Zhengyang; Zhao, Bianbian; Lai, Ruilian; Wu, Huan; Jia, Liang; Zhao, Xiaobing; Luo, Jie; Huang, Yuji; Chen, Yukun; Lin, Yuling; Lai, Zhongxiong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes y Análisis de Expresión Bajo Estrés por Baja Temperatura en el Plátano
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Quinasas de proteínas activadas por mitógenos
Estrés en plantas
Reducción de genes
Transducción de señales de hormonas vegetales
Estrés biótico
Estrés por bajas temperaturas
Licencia
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Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
Las quinas de proteínas activadas por mitógenos (MAPKs y MPKs) son importantes en el proceso de resistencia al estrés en las plantas. En este estudio, se identificaron 21, 12, 18, 16 y 10 de , , , , y , respectivamente. Estos se dividieron en los Grupos A, B, C y D. El análisis filogenético reveló que esta diferencia en número se debió a la reducción genética de la subfamilia del Grupo B de y . Las anotaciones de KEGG revelaron que K14512, que está involucrado en la transducción de señales de hormonas vegetales y en la interacción planta-patógeno, fue la vía más conservada de la . Los resultados de la predicción de elementos cis-actuantes del promotor y el análisis de expresión del transcriptoma de TR4 (f. sp. tropical race 4) confirmaron preliminarmente que estaban relacionados con las hormonas vegetales y el estrés biótico, respectivamente. La expresión de en el Grupo A se reguló significativamente al alza a 4 grados C, y de manera dramática, la en la raíz se vio afectada por la baja temperatura. miR172, miR319, miR395, miR398 y miR399 pueden ser los miARN que regulan durante el estrés por baja temperatura, siendo miR172 el más crítico. La predicción de miARN y los resultados de qRT-PCR indicaron que miR172 puede regular negativamente . Por lo tanto, dedujimos que podría coordinarse con miR172 para participar en el proceso de resistencia al estrés por baja temperatura en las raíces del plátano. Este estudio proporcionará una base teórica para un análisis más profundo del mecanismo de bajo estrés por temperatura en los plátanos, y este estudio podría aplicarse al mejoramiento molecular de los plátanos en el futuro.
Descripción
Las quinas de proteínas activadas por mitógenos (MAPKs y MPKs) son importantes en el proceso de resistencia al estrés en las plantas. En este estudio, se identificaron 21, 12, 18, 16 y 10 de , , , , y , respectivamente. Estos se dividieron en los Grupos A, B, C y D. El análisis filogenético reveló que esta diferencia en número se debió a la reducción genética de la subfamilia del Grupo B de y . Las anotaciones de KEGG revelaron que K14512, que está involucrado en la transducción de señales de hormonas vegetales y en la interacción planta-patógeno, fue la vía más conservada de la . Los resultados de la predicción de elementos cis-actuantes del promotor y el análisis de expresión del transcriptoma de TR4 (f. sp. tropical race 4) confirmaron preliminarmente que estaban relacionados con las hormonas vegetales y el estrés biótico, respectivamente. La expresión de en el Grupo A se reguló significativamente al alza a 4 grados C, y de manera dramática, la en la raíz se vio afectada por la baja temperatura. miR172, miR319, miR395, miR398 y miR399 pueden ser los miARN que regulan durante el estrés por baja temperatura, siendo miR172 el más crítico. La predicción de miARN y los resultados de qRT-PCR indicaron que miR172 puede regular negativamente . Por lo tanto, dedujimos que podría coordinarse con miR172 para participar en el proceso de resistencia al estrés por baja temperatura en las raíces del plátano. Este estudio proporcionará una base teórica para un análisis más profundo del mecanismo de bajo estrés por temperatura en los plátanos, y este estudio podría aplicarse al mejoramiento molecular de los plátanos en el futuro.