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Identificación a nivel genómico de miembros de la super familia B3 de unión al ADN (ABI, HIS, ARF, RVL, REM) y su participación en respuestas al estrés y desarrollo en

Autores: Kandeel, Mahmoud; Morsy, Mohamed A.; Abd El-Lateef, Hany M.; Marzok, Mohamed; El-Beltagi, Hossam S.; Al Khodair, Khalid M.; Albokhadaim, Ibrahim; Venugopala, Katharigatta N.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación a nivel genómico de miembros de la super familia B3 de unión al ADN (ABI, HIS, ARF, RVL, REM) y su participación en respuestas al estrés y desarrollo en


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Superfamilia de unión al ADN b3
Proteínas
Familias de genes
Respuesta al estrés
Motivos conservados
Análisis de qPCR

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 34

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La super familia de unión al ADN B3 es un grupo de familias de genes que contienen un dominio B3 en sus proteínas. Los miembros de esta super familia están involucrados en respuestas a estrés, incluyendo estrés por sal, sequía y frío. La super familia de unión al ADN B3 no ha sido completamente estudiada en . Un total de ochenta y siete miembros de esta super familia fueron identificados en . Los genes identificados fueron clasificados en cinco grupos basados en un análisis filogenético. Todas las proteínas fueron predichas como nucleares. Las familias de genes RAV y ARF tenían los motivos más conservados, con nueve de diez motivos preservados, mientras que se descubrió que la familia de genes REM tenía los menos, con solo un motivo conservado presente. Las familias de genes RAV y REM mostraron las menores interacciones proteína-proteína. Los genes CsARF5 y CsARF7 mostraron la puntuación de interacción más potente con múltiples proteínas sensibles a auxinas. Se realizó un análisis de qPCR en seis genes que mostraron cambios de expresión inducidos por estrés. Se descubrió que CsREM17, CsREM5 y CsRAVL5 aumentaron considerablemente en respuesta al estrés por sequía, mientras que CsARF10, CsARF4 y CsREM34 se encontraron considerablemente regulados a la baja. La super familia de unión al ADN B3 regula la señalización del ácido abscísico, lo que a su vez influye en el crecimiento de la planta y la resistencia al estrés.

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