Identificación a nivel genómico de la familia de genes RR y su análisis de expresión en respuesta a la inducción por TDZ en
Autores: Peng, Lvchun; Li, Xuejiao; Gao, Yan; Xie, Weijia; Zhang, Lu; Song, Jie; Li, Shifeng; Zhao, Zhengxiong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a nivel genómico de la familia de genes RR y su análisis de expresión en respuesta a la inducción por TDZ en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Citosinina
Familia de genes
Evolución filogenética
Localización cromosómica
Elementos cis del promotor
Patrones de expresión
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
El gen regulador de respuesta a citoquinina (RR) es esencial para la transducción de señales de citoquinina, que juega un papel crucial en el crecimiento y desarrollo de las plantas. Aquí, aplicamos bioinformática al genoma de para identificar su familia de genes RR y analizamos sistemáticamente sus características genéticas, evolución filogenética, localización cromosómica, análisis de colinealidad, elementos cis del promotor y patrones de expresión. En total, se distinguieron y clasificaron 33 genes en tres tipos. Todos estos genes contenían el motivo 5 (YEVTTVNSGLEALELLRENKB), el más conservado, junto con el dominio conservado en plantas (dominio REC), y podían ser mapeados a 10 cromosomas con cuatro pares de genes de eventos de replicación segmental pero sin eventos de replicación en tándem; 13 genes mostraron colinealidad con genes. El análisis del promotor reveló múltiples elementos relacionados con hormonas en los genes RR. Después de un tratamiento con TDZ (tidiazurón), 13 genes tuvieron niveles de expresión más altos que el control, cuya magnitud de cambio dependió de la etapa de desarrollo de los brotes adventicios de las hojas. Los niveles de expresión de , , , y coincidieron con el número promedio de brotes adventicios después del tratamiento con TDZ. Especulamos que estos cuatro genes podrían desempeñar un papel destacado en la regeneración de brotes a partir de hojas in vitro. Este estudio proporciona un conocimiento detallado de para la investigación sobre la señalización y funcionamiento de la citoquinina en .
Descripción
El gen regulador de respuesta a citoquinina (RR) es esencial para la transducción de señales de citoquinina, que juega un papel crucial en el crecimiento y desarrollo de las plantas. Aquí, aplicamos bioinformática al genoma de para identificar su familia de genes RR y analizamos sistemáticamente sus características genéticas, evolución filogenética, localización cromosómica, análisis de colinealidad, elementos cis del promotor y patrones de expresión. En total, se distinguieron y clasificaron 33 genes en tres tipos. Todos estos genes contenían el motivo 5 (YEVTTVNSGLEALELLRENKB), el más conservado, junto con el dominio conservado en plantas (dominio REC), y podían ser mapeados a 10 cromosomas con cuatro pares de genes de eventos de replicación segmental pero sin eventos de replicación en tándem; 13 genes mostraron colinealidad con genes. El análisis del promotor reveló múltiples elementos relacionados con hormonas en los genes RR. Después de un tratamiento con TDZ (tidiazurón), 13 genes tuvieron niveles de expresión más altos que el control, cuya magnitud de cambio dependió de la etapa de desarrollo de los brotes adventicios de las hojas. Los niveles de expresión de , , , y coincidieron con el número promedio de brotes adventicios después del tratamiento con TDZ. Especulamos que estos cuatro genes podrían desempeñar un papel destacado en la regeneración de brotes a partir de hojas in vitro. Este estudio proporciona un conocimiento detallado de para la investigación sobre la señalización y funcionamiento de la citoquinina en .