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Identificación a nivel genómico de la familia de genes NHX en l. y sus patrones de expresión bajo estrés salino

Autores: Dong, Jianmei; Liu, Cuiyu; Wang, Yuying; Zhao, Yujie; Ge, Dapeng; Yuan, Zhaohe

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2021

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Acceso abierto

Artículo científico
2021

Identificación a nivel genómico de la familia de genes NHX en l. y sus patrones de expresión bajo estrés salino


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Agronomía y Ciencia de los Cultivos

Palabras clave

Salinización del suelo
Concentraciones de NaCl
Antiporter Na/H
Granada
Expresión génica
Estrés salino

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 19

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La mayoría de las tierras cultivadas están sufriendo de salinización del suelo, lo cual es un problema global que afecta el desarrollo agrícola y la economía. Concentraciones altas de NaCl en el suelo resultan en la acumulación de Cl y Na tóxicos en las plantas. El antiportador de Na/H (NHX) puede regular la compartimentalización de Na o su salida para reducir la toxicidad de Na. Este estudio tiene como objetivo identificar los genes en granada (Punica granatum L.) a partir de las secuencias del genoma e investigar sus patrones de expresión bajo diferentes concentraciones de estrés de NaCl. En este estudio, se utilizaron las secuencias para analizar las propiedades fisicoquímicas, la evolución filogenética, los motivos conservados, las estructuras génicas, los elementos -actuantes, la estructura terciaria de proteínas y el patrón de expresión. Se identificaron un total de 10 genes, divididos en tres clados. Los motivos conservados y las estructuras génicas mostraron que la mayoría de ellos tenían un sitio de unión a amiloride (FFI/LY/FLLPPI), excepto los miembros del clado III. Había múltiples elementos -actuantes involucrados en el estrés abiótico en los genes. Además, el análisis de la red de interacción proteína-proteína sugirió que podría desempeñar roles cruciales en mantener un equilibrio de Na en las células. El análisis de qRT-PCR sugirió que tenía patrones de expresión específicos del tejido bajo estrés salino. En general, nuestros hallazgos indicaron que el podría desempeñar roles significativos en respuesta al estrés salino. Se estableció una base teórica en el presente estudio para la caracterización funcional adicional de la familia de genes NHX en granada.

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