Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes Homólogos de Soja y Caracterización Funcional de GmALKBH10Bs como Demetilasas de RNA mA y Patrones de Expresión bajo Estrés Abiótico
Autores: Zhao, Jie; Yang, Tengfeng; Liu, Peng; Liu, Huijie; Zhang, Hui; Guo, Sichao; Liu, Xiaoye; Chen, Xiaoguang; Chen, Mingjia
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes Homólogos de Soja y Caracterización Funcional de GmALKBH10Bs como Demetilasas de RNA mA y Patrones de Expresión bajo Estrés Abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Soja
Genes
ALKBH
Respuesta al estrés
GmALKBH10B
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 7
Citaciones: Sin citaciones
La soja (Glycine max (L.) Merr) es uno de los cultivos más importantes a nivel mundial, pero su rendimiento es vulnerable a los estreses abióticos. En Arabidopsis, los genes de la familia homóloga de AlkB (ALKBH) juegan un papel crucial en el desarrollo de las plantas y en la respuesta al estrés. Sin embargo, la identificación y funciones de sus genes homólogos en la soja siguen siendo poco claras. Aquí, identificamos un total de 22 genes en soja y los clasificamos en siete subfamilias según el análisis filogenético. Se analizaron los eventos de duplicación de genes entre los miembros de la familia y la estructura de los genes, los dominios conservados y los motivos de todos los genes candidatos. Al comparar los cambios en los niveles de mA en el ARNm de las raíces pilosas entre plántulas de soja que portan el vector vacío y aquellas que portan la proteína GmALKBH10B, demostramos que las cuatro proteínas GmALKBH10B son demetilasas de ARN mA in vivo. La localización subcelular y los patrones de expresión de GmALKBH10B revelaron que podrían ser funcionalmente redundantes. Además, un análisis de elementos -acoplado con datos de expresión génica demostró que los genes de subfamilia, incluidos , , , y , probablemente están involucrados en la respuesta de los elementos -a varios estímulos ambientales. En resumen, nuestro estudio es el primero en informar sobre la identificación a nivel genómico de los genes de la familia en soja y en determinar la función de las proteínas GmALKBH10B como demetilasas de ARN mA, proporcionando información sobre los genes en respuesta a estreses abióticos.
Descripción
La soja (Glycine max (L.) Merr) es uno de los cultivos más importantes a nivel mundial, pero su rendimiento es vulnerable a los estreses abióticos. En Arabidopsis, los genes de la familia homóloga de AlkB (ALKBH) juegan un papel crucial en el desarrollo de las plantas y en la respuesta al estrés. Sin embargo, la identificación y funciones de sus genes homólogos en la soja siguen siendo poco claras. Aquí, identificamos un total de 22 genes en soja y los clasificamos en siete subfamilias según el análisis filogenético. Se analizaron los eventos de duplicación de genes entre los miembros de la familia y la estructura de los genes, los dominios conservados y los motivos de todos los genes candidatos. Al comparar los cambios en los niveles de mA en el ARNm de las raíces pilosas entre plántulas de soja que portan el vector vacío y aquellas que portan la proteína GmALKBH10B, demostramos que las cuatro proteínas GmALKBH10B son demetilasas de ARN mA in vivo. La localización subcelular y los patrones de expresión de GmALKBH10B revelaron que podrían ser funcionalmente redundantes. Además, un análisis de elementos -acoplado con datos de expresión génica demostró que los genes de subfamilia, incluidos , , , y , probablemente están involucrados en la respuesta de los elementos -a varios estímulos ambientales. En resumen, nuestro estudio es el primero en informar sobre la identificación a nivel genómico de los genes de la familia en soja y en determinar la función de las proteínas GmALKBH10B como demetilasas de ARN mA, proporcionando información sobre los genes en respuesta a estreses abióticos.