Identificación a nivel genómico de la familia de genes de fitocianina y su posible función en el estrés salino en soja ( (L.) Merr.)
Autores: Wang, Li; Zhang, Jinyu; Li, Huici; Zhang, Gongzhan; Hu, Dandan; Zhang, Dan; Xu, Xinjuan; Yang, Yuming; Huang, Zhongwen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a nivel genómico de la familia de genes de fitocianina y su posible función en el estrés salino en soja ( (L.) Merr.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Fito cianinas
Familia de genes de soja
Subfamilias
Duplicaciones segmentarias
Sintenia
Respuestas al estrés.
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 23
Citaciones: Sin citaciones
Las fitocianinas (PCs), proteínas de cobre azul específicas de plantas, son cruciales para varios procesos biológicos durante el desarrollo de las plantas. Sin embargo, falta una caracterización exhaustiva de la familia de genes de soja. En este estudio, realizamos un cribado a nivel genómico de los genes de soja, y se identificaron 90 genes en el genoma de soja. Un análisis posterior reveló que la familia se categorizaba en cuatro subfamilias (estelacianinas, GmSCs; uclacianinas, GmUCs; plantacianinas, GmPLCs; y proteínas similares a nodulina temprana, GmENODLs). Un análisis en profundidad reveló que cada subfamilia específica exhibía características similares, con duplicaciones segmentarias desempeñando un papel importante en la expansión de los miembros de la familia. Además, los análisis de sintenia y restricción evolutiva sugirieron que han experimentado una fuerte presión selectiva para la purificación durante la evolución de la soja. El análisis de elementos reguladores del promotor de sugirió que podría desempeñar un papel crucial en diversas respuestas al estrés. Los patrones de expresión de mostraron variaciones específicas de tejido. Además, 23 de los podrían estar involucrados en la respuesta de la soja al estrés por sal. En resumen, nuestro estudio presenta una visión sistemática de , que no solo proporciona una base valiosa para investigaciones funcionales adicionales de , sino que también ofrece nuevas ideas sobre el mecanismo de tolerancia a la sal de la soja.
Descripción
Las fitocianinas (PCs), proteínas de cobre azul específicas de plantas, son cruciales para varios procesos biológicos durante el desarrollo de las plantas. Sin embargo, falta una caracterización exhaustiva de la familia de genes de soja. En este estudio, realizamos un cribado a nivel genómico de los genes de soja, y se identificaron 90 genes en el genoma de soja. Un análisis posterior reveló que la familia se categorizaba en cuatro subfamilias (estelacianinas, GmSCs; uclacianinas, GmUCs; plantacianinas, GmPLCs; y proteínas similares a nodulina temprana, GmENODLs). Un análisis en profundidad reveló que cada subfamilia específica exhibía características similares, con duplicaciones segmentarias desempeñando un papel importante en la expansión de los miembros de la familia. Además, los análisis de sintenia y restricción evolutiva sugirieron que han experimentado una fuerte presión selectiva para la purificación durante la evolución de la soja. El análisis de elementos reguladores del promotor de sugirió que podría desempeñar un papel crucial en diversas respuestas al estrés. Los patrones de expresión de mostraron variaciones específicas de tejido. Además, 23 de los podrían estar involucrados en la respuesta de la soja al estrés por sal. En resumen, nuestro estudio presenta una visión sistemática de , que no solo proporciona una base valiosa para investigaciones funcionales adicionales de , sino que también ofrece nuevas ideas sobre el mecanismo de tolerancia a la sal de la soja.