Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes de Pectato Liasa en Papa y Análisis de Expresión Bajo Estrés Salino
Autores: Wang, Zhiqi; Liu, Tao; Wu, Wenbo; Shi, Wenting; Shi, Jian; Mo, Fengyan; Du, Chong; Wang, Chaonan; Yang, Zhongmin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes de Pectato Liasa en Papa y Análisis de Expresión Bajo Estrés Salino
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Pectina
Enzimas
Crecimiento de plantas
Papa
Estrés salino
Familia de genes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 13
Citaciones: Sin citaciones
La pectina es un polisacárido estructural y un componente principal de las paredes celulares de las plantas. Las pectato liasas son una clase de enzimas que degradan la pectina desmetilada al romper el enlace alfa-1,4-glucosídico, y desempeñan un papel importante en el crecimiento y desarrollo de las plantas. Actualmente, se sabe poco sobre los miembros de la familia de genes y su participación en el estrés salino en la papa. En este estudio, utilizamos bioinformática para identificar a los miembros de la familia de genes de pectato liasa de la papa y analizamos sus características de secuencia de genes y aminoácidos. Los resultados mostraron que se identificaron un total de 27 miembros de la familia de genes de pectato liasa en la papa. El análisis del árbol filogenético reveló que estos genes se dividieron en ocho grupos. El análisis de sus promotores indicó que varias regiones de promotores de los miembros contenían un número significativo de elementos de respuesta a hormonas y estrés. Además, encontramos que varios miembros respondieron positivamente al tratamiento con sal bajo estrés salino simple y mixto. Dado que exhibió un patrón de expresión consistente bajo condiciones de estrés salino tanto simple como mixto, se determinó su localización subcelular. Los resultados indicaron que StPL18 está localizado en la membrana del retículo endoplásmico. Los resultados establecerán una base para analizar las funciones de los miembros de la familia de pectato liasa de la papa y su expresión bajo estrés salino.
Descripción
La pectina es un polisacárido estructural y un componente principal de las paredes celulares de las plantas. Las pectato liasas son una clase de enzimas que degradan la pectina desmetilada al romper el enlace alfa-1,4-glucosídico, y desempeñan un papel importante en el crecimiento y desarrollo de las plantas. Actualmente, se sabe poco sobre los miembros de la familia de genes y su participación en el estrés salino en la papa. En este estudio, utilizamos bioinformática para identificar a los miembros de la familia de genes de pectato liasa de la papa y analizamos sus características de secuencia de genes y aminoácidos. Los resultados mostraron que se identificaron un total de 27 miembros de la familia de genes de pectato liasa en la papa. El análisis del árbol filogenético reveló que estos genes se dividieron en ocho grupos. El análisis de sus promotores indicó que varias regiones de promotores de los miembros contenían un número significativo de elementos de respuesta a hormonas y estrés. Además, encontramos que varios miembros respondieron positivamente al tratamiento con sal bajo estrés salino simple y mixto. Dado que exhibió un patrón de expresión consistente bajo condiciones de estrés salino tanto simple como mixto, se determinó su localización subcelular. Los resultados indicaron que StPL18 está localizado en la membrana del retículo endoplásmico. Los resultados establecerán una base para analizar las funciones de los miembros de la familia de pectato liasa de la papa y su expresión bajo estrés salino.