Identificación a nivel genómico de los genes de la familia de dioxygenasas dependientes de 2-oxoglutarato y Fe (II) (2ODD-C) y perfiles de expresión bajo diferentes estrés abióticos en (L.)
Autores: Han, Jingxue; Wang, Xiaojing; Niu, Suzhen
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a nivel genómico de los genes de la familia de dioxygenasas dependientes de 2-oxoglutarato y Fe (II) (2ODD-C) y perfiles de expresión bajo diferentes estrés abióticos en (L.)
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
2-oxoglutarato
Dioxygenasa dependiente de Fe (II)
Genes
Perfiles de expresión
Tratamientos de estrés
Ingeniería genética
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
La familia de dioxygenasas dependientes de 2-oxoglutarato y Fe (II) (2ODD-C) de dioxygenasas dependientes de 2-oxoglutarato participa potencialmente en la biosíntesis de varios metabolitos bajo diversos estrés abióticos. Sin embargo, hay escasa información sobre los perfiles de expresión y roles de los genes en . Identificamos 153 genes de , y se distribuyeron de manera desigual en 15 cromosomas. Según la topología del árbol filogenético, estos genes se dividieron en 21 grupos distinguidos por motivos conservados y una estructura de intrón/exón. Los análisis de duplicación de genes revelaron que 75 genes se expandieron y retuvieron después de duplicaciones WGD/segmentales y en tándem. Los perfiles de expresión de los genes se exploraron bajo tratamientos de estrés con metil jasmonato (MeJA), polietileno glicol (PEG) y sal (NaCl). El análisis de expresión mostró que 14, 13 y 49 genes mostraron el mismo patrón de expresión bajo tratamientos de MeJA y PEG, MeJA y NaCl, y PEG y NaCl, respectivamente. Un análisis adicional mostró que dos genes, y , se regulaban al alza y a la baja significativamente después de los tratamientos con MeJA, PEG y NaCl, lo que indica que estos dos genes desempeñaron roles positivos y negativos en la mejora de la tolerancia al multi-estrés. Estos resultados proporcionan genes candidatos para el uso de tecnología de ingeniería genética para modificar plantas al mejorar la tolerancia al multi-estrés para promover la eficiencia de fitorremediación.
Descripción
La familia de dioxygenasas dependientes de 2-oxoglutarato y Fe (II) (2ODD-C) de dioxygenasas dependientes de 2-oxoglutarato participa potencialmente en la biosíntesis de varios metabolitos bajo diversos estrés abióticos. Sin embargo, hay escasa información sobre los perfiles de expresión y roles de los genes en . Identificamos 153 genes de , y se distribuyeron de manera desigual en 15 cromosomas. Según la topología del árbol filogenético, estos genes se dividieron en 21 grupos distinguidos por motivos conservados y una estructura de intrón/exón. Los análisis de duplicación de genes revelaron que 75 genes se expandieron y retuvieron después de duplicaciones WGD/segmentales y en tándem. Los perfiles de expresión de los genes se exploraron bajo tratamientos de estrés con metil jasmonato (MeJA), polietileno glicol (PEG) y sal (NaCl). El análisis de expresión mostró que 14, 13 y 49 genes mostraron el mismo patrón de expresión bajo tratamientos de MeJA y PEG, MeJA y NaCl, y PEG y NaCl, respectivamente. Un análisis adicional mostró que dos genes, y , se regulaban al alza y a la baja significativamente después de los tratamientos con MeJA, PEG y NaCl, lo que indica que estos dos genes desempeñaron roles positivos y negativos en la mejora de la tolerancia al multi-estrés. Estos resultados proporcionan genes candidatos para el uso de tecnología de ingeniería genética para modificar plantas al mejorar la tolerancia al multi-estrés para promover la eficiencia de fitorremediación.