Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes Alfin-like en el Algodón () y el Gen que Regula Negativamente la Tolerancia a la Sequía y la Salinidad
Autores: Liu, Jie; Wang, Zhicheng; Chen, Bin; Wang, Guoning; Ke, Huifeng; Zhang, Jin; Jiao, Mengjia; Wang, Yan; Xie, Meixia; Gu, Qishen; Sun, Zhengwen; Wu, Liqiang; Wang, Xingfen; Ma, Zhiying; Zhang, Yan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes Alfin-like en el Algodón () y el Gen que Regula Negativamente la Tolerancia a la Sequía y la Salinidad
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Pequeño
Familia de genes
Específica de plantas
Respuesta al estrés abiótico
Identificación a nivel genómico
árbol filogenético
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
Alfin-like (AL) es una pequeña familia de genes específicos de plantas caracterizada por un dominio estructural similar a un dedo PHD en el C-terminal y un dominio estructural DUF3594 en el N-terminal, y estos genes desempeñan roles prominentes en el desarrollo de las plantas y la respuesta al estrés abiótico. En este estudio, realizamos una identificación a nivel genómico y analizamos la familia de proteínas AL en cv. NDM8 para evaluar su respuesta a varios estreses abióticos por primera vez. Se identificaron un total de 26 genes AL en NDM8 y se clasificaron en cuatro grupos basados en un árbol filogenético. Además, el análisis de elementos cis-actuantes reveló que múltiples elementos de respuesta a fitohormonas y de respuesta al estrés abiótico eran altamente prevalentes en los promotores de los genes AL. Además, descubrimos que el gen GhAL19 podría regular negativamente los estreses por sequía y sal a través de cambios fisiológicos y bioquímicos, expresión génica y el ensayo VIGS. El estudio encontró un aumento significativo en la actividad de POD y SOD, así como un cambio significativo en MDA en plantas VIGS-NaCl y VIGS-PEG. El análisis del transcriptoma demostró que los niveles de expresión del gen de biosíntesis de ABA, genes de señalización, genes responsivos y el gen marcador relacionado con el estrés fueron regulados en líneas VIGS bajo tratamiento de sequía y NaCl. En resumen, como un TF AL puede regular negativamente la tolerancia a la sequía y la sal al regular la capacidad antioxidante y la vía mediada por ABA.
Descripción
Alfin-like (AL) es una pequeña familia de genes específicos de plantas caracterizada por un dominio estructural similar a un dedo PHD en el C-terminal y un dominio estructural DUF3594 en el N-terminal, y estos genes desempeñan roles prominentes en el desarrollo de las plantas y la respuesta al estrés abiótico. En este estudio, realizamos una identificación a nivel genómico y analizamos la familia de proteínas AL en cv. NDM8 para evaluar su respuesta a varios estreses abióticos por primera vez. Se identificaron un total de 26 genes AL en NDM8 y se clasificaron en cuatro grupos basados en un árbol filogenético. Además, el análisis de elementos cis-actuantes reveló que múltiples elementos de respuesta a fitohormonas y de respuesta al estrés abiótico eran altamente prevalentes en los promotores de los genes AL. Además, descubrimos que el gen GhAL19 podría regular negativamente los estreses por sequía y sal a través de cambios fisiológicos y bioquímicos, expresión génica y el ensayo VIGS. El estudio encontró un aumento significativo en la actividad de POD y SOD, así como un cambio significativo en MDA en plantas VIGS-NaCl y VIGS-PEG. El análisis del transcriptoma demostró que los niveles de expresión del gen de biosíntesis de ABA, genes de señalización, genes responsivos y el gen marcador relacionado con el estrés fueron regulados en líneas VIGS bajo tratamiento de sequía y NaCl. En resumen, como un TF AL puede regular negativamente la tolerancia a la sequía y la sal al regular la capacidad antioxidante y la vía mediada por ABA.