Identificación a Nivel Genómico de Factores de Transcripción WRKY de Arándano: Ve a lo Salvaje y Duplica
Autores: Felipez, Winder; Villavicencio, Jennifer; Nizolli, Valeria Oliveira; Pegoraro, Camila; da Maia, Luciano; Costa de Oliveira, Antonio
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a Nivel Genómico de Factores de Transcripción WRKY de Arándano: Ve a lo Salvaje y Duplica
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Genes de factores de transcripción
Metabolismo del arándano
Regulación de la maduración de la fruta
Biosíntesis de antocianinas
Genoma
Tipos de dominio de dedo de zinc
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 16
Citaciones: Sin citaciones
Los genes de factores de transcripción WRKY componen una familia importante de reguladores transcripcionales que están presentes en varias especies de plantas. Según estudios previos, estos genes también pueden desempeñar roles importantes en el metabolismo de los arándanos (L.), lo que hace esencial profundizar en nuestra comprensión de la regulación de la maduración de la fruta y la biosíntesis de antocianinas. En este contexto, la caracterización detallada de estas proteínas proporcionará una visión integral de las características funcionales de los genes en diferentes órganos de la planta y en respuesta a diferentes intensidades de luz. En este estudio, la investigación del genoma completo del arándano identificó 76 genes que fueron evaluados y distribuidos en los doce cromosomas. Las proteínas codificadas por estos genes fueron clasificadas en cuatro grupos (I, II, III y IV) según sus dominios conservados y tipos de dominio de dedo de zinc. Se detectaron quince pares de genes en duplicación segmental y cuatro pares en duplicación en tándem. Un análisis de elementos cis mostró que todos los promotores de los genes contienen al menos un elemento potencial de respuesta al estrés cis. El análisis de expresión diferencial de datos de RNA-seq reveló que los genes del arándano muestran expresión preferencial o específica en las muestras. Estos hallazgos proporcionan una visión general de la caracterización funcional de estas proteínas en el arándano.
Descripción
Los genes de factores de transcripción WRKY componen una familia importante de reguladores transcripcionales que están presentes en varias especies de plantas. Según estudios previos, estos genes también pueden desempeñar roles importantes en el metabolismo de los arándanos (L.), lo que hace esencial profundizar en nuestra comprensión de la regulación de la maduración de la fruta y la biosíntesis de antocianinas. En este contexto, la caracterización detallada de estas proteínas proporcionará una visión integral de las características funcionales de los genes en diferentes órganos de la planta y en respuesta a diferentes intensidades de luz. En este estudio, la investigación del genoma completo del arándano identificó 76 genes que fueron evaluados y distribuidos en los doce cromosomas. Las proteínas codificadas por estos genes fueron clasificadas en cuatro grupos (I, II, III y IV) según sus dominios conservados y tipos de dominio de dedo de zinc. Se detectaron quince pares de genes en duplicación segmental y cuatro pares en duplicación en tándem. Un análisis de elementos cis mostró que todos los promotores de los genes contienen al menos un elemento potencial de respuesta al estrés cis. El análisis de expresión diferencial de datos de RNA-seq reveló que los genes del arándano muestran expresión preferencial o específica en las muestras. Estos hallazgos proporcionan una visión general de la caracterización funcional de estas proteínas en el arándano.