Identificación a Nivel Genómico de Factores de Transcripción bZIP en Frijol Faba Basada en Análisis de Transcriptoma e Investigación de Su Función en la Respuesta a la Sequía
Autores: Huang, Lin-Tao; Liu, Chang-Yan; Li, Li; Han, Xue-Song; Chen, Hong-Wei; Jiao, Chun-Hai; Sha, Ai-Hua
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a Nivel Genómico de Factores de Transcripción bZIP en Frijol Faba Basada en Análisis de Transcriptoma e Investigación de Su Función en la Respuesta a la Sequía
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Frijol faba
Familia de genes bZIP
Factores de transcripción
Estrés abiótico
Tolerancia a la sequía
Interacción proteína-proteína
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La haba es un cultivo leguminoso comestible de temporada fría que está constantemente amenazado por estrés abiótico como la sequía. La familia de genes de la cremallera de leucina básica (bZIP) es una de las familias de factores de transcripción más abundantes y diversas en las plantas. Regula el crecimiento y desarrollo de las plantas y juega un papel importante en la respuesta a estrés biótico y abiótico. En este estudio, identificamos 18 miembros de la familia de factores de transcripción bZIP de la haba a nivel genómico, basándonos en datos de secuenciación del transcriptoma de estrés por sequía de la haba. Se construyó un árbol filogenético para agrupar las 18 proteínas VfbZIP en ocho clados. El análisis de elementos reguladores en la región del promotor sugirió que estos 18 pueden estar involucrados en la regulación de respuestas al estrés abiótico como la sequía. Los datos del transcriptoma mostraron una alta expresión de siete genes en la variedad tolerante a la sequía bajo estrés por sequía, en la cual se expresaron consistentemente como se detectó mediante reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) en comparación con los datos del transcriptoma. La sobrerregulación ectópica de los tres en tabaco, basada en el vector del virus de la papa X (PVX), reveló que mejoró la tolerancia a la sequía. Las plantas sobreexpresadas mostraron niveles más bajos de prolina (PRO), malondialdehído (MDA) y peroxidasa (POD) en comparación con aquellas que sobreexpresaron un vector vacío bajo 10 días de estrés por sequía. El análisis de interacción proteína-proteína (PPI) mostró que VfbZIP5 interactuó con siete proteínas en la haba, incluyendo VfbZIP7 y VfbZIP10. Los resultados describen la importancia de en respuesta al estrés por sequía, y serían útiles para la mejora de la tolerancia a la sequía.
Descripción
La haba es un cultivo leguminoso comestible de temporada fría que está constantemente amenazado por estrés abiótico como la sequía. La familia de genes de la cremallera de leucina básica (bZIP) es una de las familias de factores de transcripción más abundantes y diversas en las plantas. Regula el crecimiento y desarrollo de las plantas y juega un papel importante en la respuesta a estrés biótico y abiótico. En este estudio, identificamos 18 miembros de la familia de factores de transcripción bZIP de la haba a nivel genómico, basándonos en datos de secuenciación del transcriptoma de estrés por sequía de la haba. Se construyó un árbol filogenético para agrupar las 18 proteínas VfbZIP en ocho clados. El análisis de elementos reguladores en la región del promotor sugirió que estos 18 pueden estar involucrados en la regulación de respuestas al estrés abiótico como la sequía. Los datos del transcriptoma mostraron una alta expresión de siete genes en la variedad tolerante a la sequía bajo estrés por sequía, en la cual se expresaron consistentemente como se detectó mediante reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qRT-PCR) en comparación con los datos del transcriptoma. La sobrerregulación ectópica de los tres en tabaco, basada en el vector del virus de la papa X (PVX), reveló que mejoró la tolerancia a la sequía. Las plantas sobreexpresadas mostraron niveles más bajos de prolina (PRO), malondialdehído (MDA) y peroxidasa (POD) en comparación con aquellas que sobreexpresaron un vector vacío bajo 10 días de estrés por sequía. El análisis de interacción proteína-proteína (PPI) mostró que VfbZIP5 interactuó con siete proteínas en la haba, incluyendo VfbZIP7 y VfbZIP10. Los resultados describen la importancia de en respuesta al estrés por sequía, y serían útiles para la mejora de la tolerancia a la sequía.