Identificación a Nivel Genómico de la Familia Multigénica de Xiloglucano Endotransglucosilasa/Hidrolasa en Jujube Chino () y Sus Patrones de Expresión Bajo Diferentes Estrés Ambientales
Autores: Refaiy, Mohamed; Tahir, Muhammad; Jiao, Lijun; Zhang, Xiuli; Zhang, Huicheng; Chen, Yuhan; Xu, Yaru; Song, Shuang; Pang, Xiaoming
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel Genómico de la Familia Multigénica de Xiloglucano Endotransglucosilasa/Hidrolasa en Jujube Chino () y Sus Patrones de Expresión Bajo Diferentes Estrés Ambientales
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Xyloglucano
Genes
Estrés
Jujube chino
Expresión
Motivos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La familia de endotransglucosilasas/hidrolasas de xiloglucano (XTH), un grupo de enzimas modificadoras de la pared celular, desempeña roles cruciales en el crecimiento, desarrollo y adaptación al estrés de las plantas. La calidad y el rendimiento del fruto del jujube chino se ven significativamente afectados por estreses ambientales, incluyendo salinidad excesiva, sequía, congelación y enfermedades. Sin embargo, no ha habido informes sobre los genes que codifican XTH presentes en el genoma del jujube chino y su nivel de transcripción en respuesta a varios estreses. Este estudio proporciona un análisis en profundidad de los genes en el genoma del jujube chino y elucida sus motivos estructurales, redes regulatorias y patrones de expresión bajo diversos estreses. Se identificaron un total de 29 genes del genoma. El análisis filogenético clasifica los genes en cuatro grupos distintos, mientras que los análisis de motivos conservados y dominios revelan modificaciones coordinadas de xiloglucano, destacando motivos y dominios compartidos clave. Las predicciones de redes de interacción sugieren que pueden interactuar con proteínas como Expansina-B1 (EXPB1) y Pectina Metilesterasa 22 (PME22). Además, el análisis de elementos cis-regulatorios mejora nuestra comprensión de los sistemas defensivos de la planta de jujube chino, donde los motivos TCA y TGACG procesan señales ambientales y orquestan respuestas al estrés. El perfil de expresión reveló que se regulaban significativamente al alza bajo sal, sequía, congelación e infección por fitoplasma, lo que indica su participación en respuestas al estrés biótico y abiótico. En conjunto, estos hallazgos profundizan nuestra comprensión de los roles funcionales del jujube chino, enfatizando su función reguladora en las respuestas adaptativas en las plantas de jujube chino.
Descripción
La familia de endotransglucosilasas/hidrolasas de xiloglucano (XTH), un grupo de enzimas modificadoras de la pared celular, desempeña roles cruciales en el crecimiento, desarrollo y adaptación al estrés de las plantas. La calidad y el rendimiento del fruto del jujube chino se ven significativamente afectados por estreses ambientales, incluyendo salinidad excesiva, sequía, congelación y enfermedades. Sin embargo, no ha habido informes sobre los genes que codifican XTH presentes en el genoma del jujube chino y su nivel de transcripción en respuesta a varios estreses. Este estudio proporciona un análisis en profundidad de los genes en el genoma del jujube chino y elucida sus motivos estructurales, redes regulatorias y patrones de expresión bajo diversos estreses. Se identificaron un total de 29 genes del genoma. El análisis filogenético clasifica los genes en cuatro grupos distintos, mientras que los análisis de motivos conservados y dominios revelan modificaciones coordinadas de xiloglucano, destacando motivos y dominios compartidos clave. Las predicciones de redes de interacción sugieren que pueden interactuar con proteínas como Expansina-B1 (EXPB1) y Pectina Metilesterasa 22 (PME22). Además, el análisis de elementos cis-regulatorios mejora nuestra comprensión de los sistemas defensivos de la planta de jujube chino, donde los motivos TCA y TGACG procesan señales ambientales y orquestan respuestas al estrés. El perfil de expresión reveló que se regulaban significativamente al alza bajo sal, sequía, congelación e infección por fitoplasma, lo que indica su participación en respuestas al estrés biótico y abiótico. En conjunto, estos hallazgos profundizan nuestra comprensión de los roles funcionales del jujube chino, enfatizando su función reguladora en las respuestas adaptativas en las plantas de jujube chino.