Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Factores de Transcripción bHLH en y Exploración Funcional del Gen bajo Infección por Cancro
Autores: Jia, Shanshan; Liu, Xiaojie; Wen, Xuejing; Waheed, Abdul; Ding, Yu; Kahar, Gulnaz; Li, Xiaoshuang; Zhang, Daoyuan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Factores de Transcripción bHLH en y Exploración Funcional del Gen bajo Infección por Cancro
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Manzana silvestre
Factores de transcripción
Gen bHLH
Propiedades fisicoquímicas
Elementos cis-actuantes
Respuestas de defensa
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
La manzana silvestre de Xinjiang es un relicto antiguo; una planta con abundante diversidad genética y resistencia a enfermedades. Se estudiaron varios factores de transcripción en respuesta a diferentes estrés bióticos y abióticos en la manzana silvestre. La familia de factores de transcripción básica/helix-loop-helix (bHLH) es una gran familia de factores de transcripción de plantas que desempeña roles importantes en las respuestas de las plantas a varios estrés bióticos y abióticos y ha sido ampliamente estudiada en varias plantas. Sin embargo, aún no se ha realizado ningún estudio sobre el gen bHLH en . Basado en el genoma de , se identificaron 184 genes putativos y se estudiaron sus propiedades fisicoquímicas. cubrió 23 subfamilias y carecía de dos genes de subfamilia de según el método de clasificación ampliamente utilizado. Además, las estructuras de exón-intrón coincidieron con la clasificación de subfamilias, como lo demuestra el análisis de sus motivos proteicos. El análisis de elementos cis-actuantes reveló que muchos genes comparten elementos cis-reguladores relacionados con el estrés y las hormonas. Se encontró que estos factores de transcripción MsbHLH estaban involucrados en las respuestas de defensa de las plantas, basándose en las interacciones proteína-proteína entre los genes expresados diferencialmente. Además, 94 genes se expresaron diferencialmente en respuesta a bacterias patógenas. Los resultados de qRT-PCR también mostraron expresión diferencial de genes. Para verificar aún más la función del gen bHLH, nuestro estudio utilizó el método de transformación transitoria para obtener las plantas transgénicas sobreexpresadas e inocularlas. Bajo la infección por cancro, el fenotipo de la lesión y los índices fisiológicos y bioquímicos indicaron que la capacidad antioxidante de las plantas podría aumentar y reducir el daño causado por la peroxidación de membranas. Este estudio proporciona información detallada sobre la clasificación, estructura genética, motivos, distribución cromosómica y expresión génica de los genes en y sienta las bases para una mejor comprensión de la resistencia a enfermedades en las plantas, así como para proporcionar genes candidatos para el desarrollo de la cría de resistencia.
Descripción
La manzana silvestre de Xinjiang es un relicto antiguo; una planta con abundante diversidad genética y resistencia a enfermedades. Se estudiaron varios factores de transcripción en respuesta a diferentes estrés bióticos y abióticos en la manzana silvestre. La familia de factores de transcripción básica/helix-loop-helix (bHLH) es una gran familia de factores de transcripción de plantas que desempeña roles importantes en las respuestas de las plantas a varios estrés bióticos y abióticos y ha sido ampliamente estudiada en varias plantas. Sin embargo, aún no se ha realizado ningún estudio sobre el gen bHLH en . Basado en el genoma de , se identificaron 184 genes putativos y se estudiaron sus propiedades fisicoquímicas. cubrió 23 subfamilias y carecía de dos genes de subfamilia de según el método de clasificación ampliamente utilizado. Además, las estructuras de exón-intrón coincidieron con la clasificación de subfamilias, como lo demuestra el análisis de sus motivos proteicos. El análisis de elementos cis-actuantes reveló que muchos genes comparten elementos cis-reguladores relacionados con el estrés y las hormonas. Se encontró que estos factores de transcripción MsbHLH estaban involucrados en las respuestas de defensa de las plantas, basándose en las interacciones proteína-proteína entre los genes expresados diferencialmente. Además, 94 genes se expresaron diferencialmente en respuesta a bacterias patógenas. Los resultados de qRT-PCR también mostraron expresión diferencial de genes. Para verificar aún más la función del gen bHLH, nuestro estudio utilizó el método de transformación transitoria para obtener las plantas transgénicas sobreexpresadas e inocularlas. Bajo la infección por cancro, el fenotipo de la lesión y los índices fisiológicos y bioquímicos indicaron que la capacidad antioxidante de las plantas podría aumentar y reducir el daño causado por la peroxidación de membranas. Este estudio proporciona información detallada sobre la clasificación, estructura genética, motivos, distribución cromosómica y expresión génica de los genes en y sienta las bases para una mejor comprensión de la resistencia a enfermedades en las plantas, así como para proporcionar genes candidatos para el desarrollo de la cría de resistencia.