Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes y Análisis del Patrón de Expresión en (L.) bajo Estréses Abióticos
Autores: Xue, Baoping; Liang, Zicong; Liu, Yue; Li, Dongyang; Liu, Chang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel Genómico de la Familia de Genes y Análisis del Patrón de Expresión en (L.) bajo Estréses Abióticos
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Molécula de señalización
Crecimiento
Desarrollo
Familia de genes
Genoma de maíz
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
El Factor de Alcalinización Rápida (RALF) es una molécula de señalización en las plantas que desempeña un papel crucial en el crecimiento y desarrollo, los procesos reproductivos y las respuestas tanto a estrés biótico como abiótico. Aunque los péptidos RALF han sido caracterizados en arroz, aún falta un análisis bioinformático integral de la familia de genes en maíz. En este estudio, identificamos 20 genes en el genoma de maíz. La alineación de secuencias reveló una variación estructural significativa entre los genes de la familia. El análisis filogenético indica que las proteínas RALF de arroz y maíz pueden clasificarse en cuatro clados distintos. Los eventos de duplicación sugieren que la expansión de la familia de genes en maíz se basa principalmente en la duplicación del genoma completo. Los genes se expresan ampliamente en varios tejidos; se expresan en alta cantidad en raíces, mientras que se expresan predominantemente en anteras. El RNA-seq y RT-qPCR demostraron que los niveles de expresión de , , y se regulaban significativamente al alza y a la baja en respuesta a los estreses de PEG y NaCl, respectivamente. En general, nuestro estudio proporciona nuevas perspectivas sobre el papel de la familia de genes en el estrés abiótico.
Descripción
El Factor de Alcalinización Rápida (RALF) es una molécula de señalización en las plantas que desempeña un papel crucial en el crecimiento y desarrollo, los procesos reproductivos y las respuestas tanto a estrés biótico como abiótico. Aunque los péptidos RALF han sido caracterizados en arroz, aún falta un análisis bioinformático integral de la familia de genes en maíz. En este estudio, identificamos 20 genes en el genoma de maíz. La alineación de secuencias reveló una variación estructural significativa entre los genes de la familia. El análisis filogenético indica que las proteínas RALF de arroz y maíz pueden clasificarse en cuatro clados distintos. Los eventos de duplicación sugieren que la expansión de la familia de genes en maíz se basa principalmente en la duplicación del genoma completo. Los genes se expresan ampliamente en varios tejidos; se expresan en alta cantidad en raíces, mientras que se expresan predominantemente en anteras. El RNA-seq y RT-qPCR demostraron que los niveles de expresión de , , y se regulaban significativamente al alza y a la baja en respuesta a los estreses de PEG y NaCl, respectivamente. En general, nuestro estudio proporciona nuevas perspectivas sobre el papel de la familia de genes en el estrés abiótico.