Identificación a Nivel del Genoma de Genes de la Familia NAC en Avena y Caracterización Funcional en la Tolerancia al Estrés Abiótico
Autores: Xu, Yahui; Cheng, Jialong; Hu, Haibin; Yan, Lin; Jia, Juqing; Wu, Bin
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Identificación a Nivel del Genoma de Genes de la Familia NAC en Avena y Caracterización Funcional en la Tolerancia al Estrés Abiótico
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Familia de genes específica de plantas
Familias de factores de transcripción
Genoma de avena
Estructura del gen
Estrés abiótico
Duplicaciones de genes
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
La familia de genes específica de plantas es una de las familias de factores de transcripción más grandes, participando en la regulación del crecimiento de las plantas y la respuesta al estrés. A pesar de la extensa caracterización en varias plantas, nuestro conocimiento de la familia en la avena es limitado. Aquí, identificamos 333 genes de la última versión del genoma de la avena común. Proporcionamos una visión general completa de la familia de genes de la avena, cubriendo la estructura del gen, la localización cromosómica, las características filogenéticas, las composiciones de motivos conservados y las duplicaciones de genes. La expresión génica en diferentes tejidos y la respuesta a varios estreses abióticos se caracterizaron utilizando RT-qPCR. El principal impulsor de la expansión de la familia de genes de la avena se identificó como duplicación segmentaria mediante análisis de colinealidad. Además, se aclararon las funciones de la regulación de la tolerancia al estrés abiótico. Esta es la primera investigación a nivel genómico de la familia de genes en la avena cultivada, que proporciona un recurso único para investigaciones posteriores para elucidar los mecanismos responsables de la tolerancia al estrés en la avena y ofrece pistas valiosas para la mejora de la resistencia al estrés en la avena cultivada.
Descripción
La familia de genes específica de plantas es una de las familias de factores de transcripción más grandes, participando en la regulación del crecimiento de las plantas y la respuesta al estrés. A pesar de la extensa caracterización en varias plantas, nuestro conocimiento de la familia en la avena es limitado. Aquí, identificamos 333 genes de la última versión del genoma de la avena común. Proporcionamos una visión general completa de la familia de genes de la avena, cubriendo la estructura del gen, la localización cromosómica, las características filogenéticas, las composiciones de motivos conservados y las duplicaciones de genes. La expresión génica en diferentes tejidos y la respuesta a varios estreses abióticos se caracterizaron utilizando RT-qPCR. El principal impulsor de la expansión de la familia de genes de la avena se identificó como duplicación segmentaria mediante análisis de colinealidad. Además, se aclararon las funciones de la regulación de la tolerancia al estrés abiótico. Esta es la primera investigación a nivel genómico de la familia de genes en la avena cultivada, que proporciona un recurso único para investigaciones posteriores para elucidar los mecanismos responsables de la tolerancia al estrés en la avena y ofrece pistas valiosas para la mejora de la resistencia al estrés en la avena cultivada.