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Identificación a Nivel del Genoma de la Familia de Genes PP2C y Análisis de su Perfil de Expresión en Respuesta al Estrés por Frío en la Caña de Azúcar Silvestre

Autores: Huang, Xing; Liang, Yongsheng; Zhang, Ronghua; Zhang, Baoqing; Song, Xiupeng; Liu, Junxian; Lu, Manman; Qin, Zhenqiang; Li, Dewei; Li, Song; Li, Yangrui

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación a Nivel del Genoma de la Familia de Genes PP2C y Análisis de su Perfil de Expresión en Respuesta al Estrés por Frío en la Caña de Azúcar Silvestre


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Fosfatasa de proteínas
PP2Cs
Caña de azúcar silvestre
Análisis filogenético
Estructura génica
Cloroplasto

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 12

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Las fosfatasas de proteínas tipo 2C (PP2Cs) representan un grupo importante de fosfatasas de proteínas en las plantas, algunas de las cuales ya se ha confirmado que desempeñan roles importantes en diversos procesos vegetales. En este estudio, se llevaron a cabo análisis de la filogenética, la estructura génica, el dominio proteico, la localización cromosómica y la colinealidad, así como una identificación del perfil de expresión, la interacción proteína-proteína y la localización subcelular, en la familia PP2C en la caña de azúcar silvestre. Los resultados mostraron que 145 proteínas PP2C se clasificaron en 13 clados. El análisis filogenético sugirió que las SsPP2Cs están evolutivamente más cercanas a las de sorgo, y el número de SsPP2Cs es el más alto. Hubo 124 pares de genes que se expandieron a través de duplicaciones segmentarias. Se predijo que la mitad de las proteínas SsPP2C se localizan en el cloroplasto (73), siendo las siguientes localizaciones más comunes en el citoplasma (37) y el núcleo (17). El análisis del promotor reveló que podría ser fotosensible, sensible a estrés abiótico y estimulado por hormonas. Un total de 27 genes mostraron expresiones inducidas por estrés por frío, y (Sspon.01G0007840-2D) y (Sspon.03G0002800-3D) fueron los posibles centros involucrados en la transducción de señales de ABA. Nuestro estudio presenta un análisis integral de la familia de genes SsPP2C, que puede desempeñar un papel vital en el estudio posterior de las fosfatasas en la caña de azúcar silvestre. Los resultados sugieren que la familia PP2C está evolutivamente conservada y que funciona en varios procesos de desarrollo en la caña de azúcar silvestre.

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