Identificación a Nivel del Genoma de la Familia de Genes PP2C y Análisis de su Perfil de Expresión en Respuesta al Estrés por Frío en la Caña de Azúcar Silvestre
Autores: Huang, Xing; Liang, Yongsheng; Zhang, Ronghua; Zhang, Baoqing; Song, Xiupeng; Liu, Junxian; Lu, Manman; Qin, Zhenqiang; Li, Dewei; Li, Song; Li, Yangrui
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Identificación a Nivel del Genoma de la Familia de Genes PP2C y Análisis de su Perfil de Expresión en Respuesta al Estrés por Frío en la Caña de Azúcar Silvestre
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Fosfatasa de proteínas
PP2Cs
Caña de azúcar silvestre
Análisis filogenético
Estructura génica
Cloroplasto
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
Las fosfatasas de proteínas tipo 2C (PP2Cs) representan un grupo importante de fosfatasas de proteínas en las plantas, algunas de las cuales ya se ha confirmado que desempeñan roles importantes en diversos procesos vegetales. En este estudio, se llevaron a cabo análisis de la filogenética, la estructura génica, el dominio proteico, la localización cromosómica y la colinealidad, así como una identificación del perfil de expresión, la interacción proteína-proteína y la localización subcelular, en la familia PP2C en la caña de azúcar silvestre. Los resultados mostraron que 145 proteínas PP2C se clasificaron en 13 clados. El análisis filogenético sugirió que las SsPP2Cs están evolutivamente más cercanas a las de sorgo, y el número de SsPP2Cs es el más alto. Hubo 124 pares de genes que se expandieron a través de duplicaciones segmentarias. Se predijo que la mitad de las proteínas SsPP2C se localizan en el cloroplasto (73), siendo las siguientes localizaciones más comunes en el citoplasma (37) y el núcleo (17). El análisis del promotor reveló que podría ser fotosensible, sensible a estrés abiótico y estimulado por hormonas. Un total de 27 genes mostraron expresiones inducidas por estrés por frío, y (Sspon.01G0007840-2D) y (Sspon.03G0002800-3D) fueron los posibles centros involucrados en la transducción de señales de ABA. Nuestro estudio presenta un análisis integral de la familia de genes SsPP2C, que puede desempeñar un papel vital en el estudio posterior de las fosfatasas en la caña de azúcar silvestre. Los resultados sugieren que la familia PP2C está evolutivamente conservada y que funciona en varios procesos de desarrollo en la caña de azúcar silvestre.
Descripción
Las fosfatasas de proteínas tipo 2C (PP2Cs) representan un grupo importante de fosfatasas de proteínas en las plantas, algunas de las cuales ya se ha confirmado que desempeñan roles importantes en diversos procesos vegetales. En este estudio, se llevaron a cabo análisis de la filogenética, la estructura génica, el dominio proteico, la localización cromosómica y la colinealidad, así como una identificación del perfil de expresión, la interacción proteína-proteína y la localización subcelular, en la familia PP2C en la caña de azúcar silvestre. Los resultados mostraron que 145 proteínas PP2C se clasificaron en 13 clados. El análisis filogenético sugirió que las SsPP2Cs están evolutivamente más cercanas a las de sorgo, y el número de SsPP2Cs es el más alto. Hubo 124 pares de genes que se expandieron a través de duplicaciones segmentarias. Se predijo que la mitad de las proteínas SsPP2C se localizan en el cloroplasto (73), siendo las siguientes localizaciones más comunes en el citoplasma (37) y el núcleo (17). El análisis del promotor reveló que podría ser fotosensible, sensible a estrés abiótico y estimulado por hormonas. Un total de 27 genes mostraron expresiones inducidas por estrés por frío, y (Sspon.01G0007840-2D) y (Sspon.03G0002800-3D) fueron los posibles centros involucrados en la transducción de señales de ABA. Nuestro estudio presenta un análisis integral de la familia de genes SsPP2C, que puede desempeñar un papel vital en el estudio posterior de las fosfatasas en la caña de azúcar silvestre. Los resultados sugieren que la familia PP2C está evolutivamente conservada y que funciona en varios procesos de desarrollo en la caña de azúcar silvestre.