El color del pelaje y el peso al nacer, como rasgos fácilmente seleccionables en el ganado, juegan roles importantes en la cría de ganado. Por lo tanto, llevamos a cabo un estudio de asociación a nivel genómico sobre el peso al nacer y el color del pelaje para identificar loci o regiones de posible ligadura en 233 bovinos de carne cruzados Simmental x Holstein. Los resultados revelaron que nueve SNPs estaban significativamente asociados con el color del pelaje, y estos se encontraban en BTA5. Curiosamente, algunos SNPs mostraron un fuerte desequilibrio de ligadura y estaban significativamente asociados con el color del pelaje. Notablemente, algunos SNPs estaban localizados en el gen. Entre los cinco SNPs significativos asociados con el color del pelaje, el peso al nacer de los individuos heterocigotos (AB) fue mayor que el de los individuos homocigotos (AA). Notablemente, el peso al nacer de los individuos heterocigotos con ciertos genotipos fue significativamente mayor que el de los individuos homocigotos. Curiosamente, los dos loci eran homocigotos en individuos negro/blanco y heterocigotos en individuos gris/blanco, y el peso al nacer de los individuos heterocigotos marrón/blanco fue mayor que el de los individuos homocigotos. El peso al nacer de los terneros con el color parental fue significativamente menor que el de los terneros con un color no parental, y el peso al nacer de los individuos gris/blanco fue el más alto. En general, parece ser un gen candidato que afecta el color del pelaje en el ganado, y el color del pelaje puede tener un efecto selectivo sobre el peso al nacer. Este estudio proporciona una base para la cría de ganado de carne a través de GWAS para el color del pelaje y el peso al nacer.