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Identificación del gen de la proteína asociada a la queratina 22-2 y asociación de su variación con rasgos de cachemira

Autores: Chen, Zhanzhao; Cao, Jian; Zhao, Fangfang; He, Zhaohua; Sun, Hongxian; Wang, Jiqing; Liu, Xiu; Li, Shaobin

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación del gen de la proteína asociada a la queratina 22-2 y asociación de su variación con rasgos de cachemira


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Zootecnia

Palabras clave

Cabra de cachemira
Proteínas asociadas a la queratina
Variantes genéticas
Polimorfismos de un solo nucleótido
Diámetro de la fibra
Marcador molecular

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 10

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La cabra Cashmere es una excelente raza local de cabra en la provincia de Gansu, China, y se espera que mejore la producción y calidad del cashmere a través de la selección y cría para aumentar su valor comercial. Las proteínas asociadas a la queratina (KAPs) juegan un papel importante en el mantenimiento de la estructura de la lana. Se ha identificado el gen que codifica la proteína asociada a la queratina 22-2 en especies seleccionadas distintas a las cabras, como humanos, ratones y ovejas. En este estudio, la secuencia del gen de la oveja se alineó en el genoma de la cabra, y se asumió que la secuencia con la mayor homología era la secuencia de la cabra y se utilizó para diseñar cebadores para amplificar la secuencia del gen de la cabra. Se utilizaron un total de 356 cabras Cashmere Longdong (provincia de Gansu, China) para la detección de variantes genéticas. Se detectaron cuatro bandas específicas mediante análisis de reacción en cadena de la polimerasa-polimorfismo conformacional de cadena simple (PCR-SSCP), y formaron un total de seis tipos de bandas individualmente o en combinación. Se identificaron cuatro alelos mediante secuenciación de ADN de los productos de amplificación por PCR. Se detectaron un total de cuatro sitios polimórficos de nucleótido simple (SNPs) en los cuatro alelos secuenciados. Dos de ellos están en la región 5"UTR y los otros dos están en la región codificante, y las variantes en la región codificante son todas mutaciones no sinónimas. Además, hubo una variación de longitud de 6 pb en el alelo C. El gen se expresó en la capa cortical de los folículos pilosos primarios y secundarios, la vaina interna de la raíz, así como en las papilas del cabello y las células maternas del cabello en las cabras. Los resultados del análisis de correlación entre genotipos y rasgos de cashmere mostraron que, después de excluir genotipos con una frecuencia genética de menos del 5%, el diámetro medio de la fibra (MFD) del cashmere fue significativamente mayor en el genotipo AB que en los genotipos AA y AC. Es decir, las variantes genéticas están asociadas con el diámetro medio de la fibra en el cashmere. Los resultados anteriores sugieren que la variante de cabra puede ser utilizada como un gen candidato marcador molecular para los rasgos de cashmere.

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