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Identificación de la familia de factores de transcripción NAC durante el desarrollo temprano de semillas en (.) Koidz

Autores: Liu, Huijuan; Chen, Songshu; Wu, Xiaomao; Li, Jinling; Xu, Cunbin; Huang, Mingjin; Wang, Hualei; Liu, Hongchang; Zhao, Zhi

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Identificación de la familia de factores de transcripción NAC durante el desarrollo temprano de semillas en (.) Koidz


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Función
NACs
Crecimiento de plantas
Desarrollo
Genes
Evolución
Metabolismo

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 10

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Este estudio tuvo como objetivo comprender la posible función de los NAC al examinar sus propiedades fisicoquímicas, estructura, ubicación cromosómica y expresión. Siendo una familia de factores de transcripción específicos de plantas, NAC (no apical meristem de petunia y ATAF1, ATAF2 y CUC2) está involucrado en el crecimiento y desarrollo de las plantas. Ninguno de los genes NAC ha sido reportado en Koidz. En este estudio, identificamos 101 proteínas NAC (AktNACs) en el genoma mediante análisis bioinformático. Ciento un AktNACs fueron clasificados en las siguientes doce categorías basadas en el análisis filogenético de la proteína NAC: NAC-a, NAC-b, NAC-c, NAC-d, NAC-e, NAC-f, NAC-g, NAC-h, NAC-i, NAC-j, NAC-k y NAC-l. La precisión de los resultados de agrupamiento se demostró en función de la estructura del gen y el análisis de motivos conservados de los AktNACs. Además, identificamos 44 pares de genes duplicados, confirmando la importancia de la selección purificadora en la evolución de los AktNACs. La morfología y microestructura del desarrollo temprano de las semillas mostró que principalmente experimentó una rápida división celular, aumento de tamaño de la semilla, formación de embrión y desarrollo del endospermo. Construimos una red de coexpresión de AktNACs y una red de correlación de metabolitos basada en datos transcriptómicos y metabolómicos de semillas. Los resultados de la red de coexpresión mostraron que 25 genes AtNAC se coexpresaron con 233 factores de transcripción. El análisis de correlación de metabolitos mostró que 23 AktNACs estaban altamente correlacionados con 28 metabolitos regulados al alza. Adicionalmente, 25 AktNACs y 235 factores de transcripción formaron redes de coexpresión con 141 metabolitos, basadas en un análisis de correlación que involucraba a AktNACs, factores de transcripción y metabolitos. Notablemente, participa en la síntesis de 35 metabolitos distintos. Ocho de estos metabolitos, fuertemente correlacionados, se regulaban al alza durante el desarrollo temprano de las semillas. Estos estudios pueden proporcionar información sobre la evolución, posible función y expresión de los genes AktNACs.

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